Protein–RNA interactions for Protein: P84104

Srsf3, Serine/arginine-rich splicing factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf3P84104 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf3P84104 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf3P84104 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srsf3P84104 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Srsf3P84104 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf3P84104 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srsf3P84104 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf3P84104 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf3P84104 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf3P84104 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srsf3P84104 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srsf3P84104 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srsf3P84104 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srsf3P84104 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srsf3P84104 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srsf3P84104 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf3P84104 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf3P84104 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf3P84104 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf3P84104 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srsf3P84104 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srsf3P84104 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srsf3P84104 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srsf3P84104 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srsf3P84104 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srsf3P84104 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srsf3P84104 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srsf3P84104 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srsf3P84104 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Srsf3P84104 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srsf3P84104 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srsf3P84104 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Srsf3P84104 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srsf3P84104 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srsf3P84104 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srsf3P84104 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srsf3P84104 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf3P84104 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf3P84104 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf3P84104 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srsf3P84104 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf3P84104 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf3P84104 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf3P84104 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srsf3P84104 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Srsf3P84104 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srsf3P84104 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srsf3P84104 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srsf3P84104 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srsf3P84104 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srsf3P84104 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Srsf3P84104 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srsf3P84104 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srsf3P84104 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srsf3P84104 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf3P84104 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf3P84104 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srsf3P84104 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srsf3P84104 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srsf3P84104 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srsf3P84104 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Srsf3P84104 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Srsf3P84104 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Srsf3P84104 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Srsf3P84104 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Srsf3P84104 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Srsf3P84104 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf3P84104 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf3P84104 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Srsf3P84104 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Srsf3P84104 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srsf3P84104 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srsf3P84104 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srsf3P84104 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srsf3P84104 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srsf3P84104 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srsf3P84104 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srsf3P84104 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srsf3P84104 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srsf3P84104 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srsf3P84104 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf3P84104 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf3P84104 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf3P84104 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf3P84104 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf3P84104 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf3P84104 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf3P84104 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf3P84104 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf3P84104 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf3P84104 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srsf3P84104 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf3P84104 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf3P84104 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf3P84104 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf3P84104 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf3P84104 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf3P84104 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf3P84104 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf3P84104 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms