Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sparcl1P70663 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sparcl1P70663 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sparcl1P70663 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sparcl1P70663 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sparcl1P70663 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Sparcl1P70663 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sparcl1P70663 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sparcl1P70663 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sparcl1P70663 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sparcl1P70663 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sparcl1P70663 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sparcl1P70663 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sparcl1P70663 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sparcl1P70663 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sparcl1P70663 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sparcl1P70663 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sparcl1P70663 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sparcl1P70663 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sparcl1P70663 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sparcl1P70663 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sparcl1P70663 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sparcl1P70663 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sparcl1P70663 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sparcl1P70663 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sparcl1P70663 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Sparcl1P70663 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sparcl1P70663 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sparcl1P70663 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sparcl1P70663 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sparcl1P70663 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Sparcl1P70663 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sparcl1P70663 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sparcl1P70663 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sparcl1P70663 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sparcl1P70663 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sparcl1P70663 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sparcl1P70663 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sparcl1P70663 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sparcl1P70663 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sparcl1P70663 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sparcl1P70663 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sparcl1P70663 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sparcl1P70663 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sparcl1P70663 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sparcl1P70663 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sparcl1P70663 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sparcl1P70663 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sparcl1P70663 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sparcl1P70663 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sparcl1P70663 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sparcl1P70663 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sparcl1P70663 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sparcl1P70663 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sparcl1P70663 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sparcl1P70663 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sparcl1P70663 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sparcl1P70663 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sparcl1P70663 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sparcl1P70663 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sparcl1P70663 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sparcl1P70663 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sparcl1P70663 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sparcl1P70663 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sparcl1P70663 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Sparcl1P70663 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sparcl1P70663 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sparcl1P70663 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sparcl1P70663 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sparcl1P70663 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sparcl1P70663 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sparcl1P70663 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Sparcl1P70663 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sparcl1P70663 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sparcl1P70663 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sparcl1P70663 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Sparcl1P70663 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Sparcl1P70663 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sparcl1P70663 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sparcl1P70663 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sparcl1P70663 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sparcl1P70663 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sparcl1P70663 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sparcl1P70663 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Sparcl1P70663 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sparcl1P70663 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sparcl1P70663 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sparcl1P70663 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sparcl1P70663 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sparcl1P70663 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sparcl1P70663 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sparcl1P70663 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sparcl1P70663 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sparcl1P70663 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sparcl1P70663 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sparcl1P70663 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sparcl1P70663 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sparcl1P70663 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sparcl1P70663 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sparcl1P70663 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms