Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,07
Plxna3P70208 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Plxna3P70208 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Plxna3P70208 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Plxna3P70208 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Plxna3P70208 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Plxna3P70208 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Plxna3P70208 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Plxna3P70208 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Plxna3P70208 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Plxna3P70208 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Plxna3P70208 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Plxna3P70208 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Plxna3P70208 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Plxna3P70208 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Plxna3P70208 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Plxna3P70208 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Plxna3P70208 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Plxna3P70208 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Plxna3P70208 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Plxna3P70208 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Plxna3P70208 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Plxna3P70208 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Plxna3P70208 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Plxna3P70208 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Plxna3P70208 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,74■■■□□ 2,03
Plxna3P70208 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Plxna3P70208 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Plxna3P70208 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Plxna3P70208 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,03
Plxna3P70208 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Plxna3P70208 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Plxna3P70208 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Plxna3P70208 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Plxna3P70208 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Plxna3P70208 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Plxna3P70208 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Plxna3P70208 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Plxna3P70208 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Plxna3P70208 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Plxna3P70208 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Plxna3P70208 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Plxna3P70208 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Plxna3P70208 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Plxna3P70208 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Plxna3P70208 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Plxna3P70208 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27,54■■■□□ 2
Plxna3P70208 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27,53■■■□□ 2
Plxna3P70208 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Plxna3P70208 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Plxna3P70208 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Plxna3P70208 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Plxna3P70208 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Plxna3P70208 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Plxna3P70208 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Plxna3P70208 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Plxna3P70208 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Plxna3P70208 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Plxna3P70208 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27,42■■□□□ 1,98
Plxna3P70208 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27,42■■□□□ 1,98
Plxna3P70208 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Plxna3P70208 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Plxna3P70208 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Plxna3P70208 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Plxna3P70208 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Plxna3P70208 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Plxna3P70208 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Plxna3P70208 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Plxna3P70208 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Plxna3P70208 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Plxna3P70208 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Plxna3P70208 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Plxna3P70208 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Plxna3P70208 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Plxna3P70208 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Plxna3P70208 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Plxna3P70208 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Plxna3P70208 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Plxna3P70208 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Plxna3P70208 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Plxna3P70208 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Plxna3P70208 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Plxna3P70208 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Plxna3P70208 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Plxna3P70208 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Plxna3P70208 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Plxna3P70208 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Plxna3P70208 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Plxna3P70208 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Plxna3P70208 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Plxna3P70208 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Plxna3P70208 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Plxna3P70208 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Plxna3P70208 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Plxna3P70208 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Plxna3P70208 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Plxna3P70208 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Plxna3P70208 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Plxna3P70208 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Plxna3P70208 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,6 ms