Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Traf5P70191 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Traf5P70191 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Traf5P70191 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Traf5P70191 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Traf5P70191 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Traf5P70191 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Traf5P70191 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Traf5P70191 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Traf5P70191 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Traf5P70191 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Traf5P70191 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Traf5P70191 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Traf5P70191 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Traf5P70191 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Traf5P70191 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Traf5P70191 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Traf5P70191 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Traf5P70191 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Traf5P70191 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Traf5P70191 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Traf5P70191 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Traf5P70191 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Traf5P70191 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Traf5P70191 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Traf5P70191 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Traf5P70191 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Traf5P70191 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Traf5P70191 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Traf5P70191 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Traf5P70191 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Traf5P70191 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Traf5P70191 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Traf5P70191 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Traf5P70191 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Traf5P70191 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Traf5P70191 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Traf5P70191 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Traf5P70191 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Traf5P70191 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Traf5P70191 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Traf5P70191 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Traf5P70191 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Traf5P70191 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Traf5P70191 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Traf5P70191 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Traf5P70191 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Traf5P70191 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Traf5P70191 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Traf5P70191 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Traf5P70191 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Traf5P70191 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Traf5P70191 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Traf5P70191 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Traf5P70191 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Traf5P70191 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Traf5P70191 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Traf5P70191 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Traf5P70191 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Traf5P70191 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Traf5P70191 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Traf5P70191 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Traf5P70191 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Traf5P70191 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Traf5P70191 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Traf5P70191 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Traf5P70191 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Traf5P70191 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Traf5P70191 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Traf5P70191 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Traf5P70191 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Traf5P70191 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Traf5P70191 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Traf5P70191 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Traf5P70191 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Traf5P70191 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Traf5P70191 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Traf5P70191 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Traf5P70191 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Traf5P70191 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Traf5P70191 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Traf5P70191 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Traf5P70191 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Traf5P70191 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Traf5P70191 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Traf5P70191 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Traf5P70191 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Traf5P70191 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Traf5P70191 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Traf5P70191 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Traf5P70191 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Traf5P70191 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Traf5P70191 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Traf5P70191 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Traf5P70191 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Traf5P70191 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Traf5P70191 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Traf5P70191 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Traf5P70191 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Traf5P70191 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms