Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Barhl1P63157 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Barhl1P63157 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Barhl1P63157 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Barhl1P63157 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Barhl1P63157 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Barhl1P63157 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Barhl1P63157 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Barhl1P63157 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Barhl1P63157 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Barhl1P63157 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Barhl1P63157 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Barhl1P63157 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Barhl1P63157 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Barhl1P63157 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Barhl1P63157 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Barhl1P63157 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Barhl1P63157 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barhl1P63157 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Barhl1P63157 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barhl1P63157 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barhl1P63157 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barhl1P63157 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barhl1P63157 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barhl1P63157 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barhl1P63157 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barhl1P63157 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Barhl1P63157 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barhl1P63157 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barhl1P63157 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barhl1P63157 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barhl1P63157 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Barhl1P63157 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl1P63157 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl1P63157 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barhl1P63157 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barhl1P63157 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Barhl1P63157 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Barhl1P63157 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Barhl1P63157 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Barhl1P63157 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Barhl1P63157 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Barhl1P63157 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Barhl1P63157 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Barhl1P63157 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Barhl1P63157 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Barhl1P63157 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Barhl1P63157 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Barhl1P63157 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Barhl1P63157 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Barhl1P63157 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Barhl1P63157 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Barhl1P63157 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Barhl1P63157 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Barhl1P63157 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Barhl1P63157 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Barhl1P63157 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Barhl1P63157 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Barhl1P63157 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Barhl1P63157 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Barhl1P63157 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Barhl1P63157 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Barhl1P63157 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Barhl1P63157 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Barhl1P63157 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Barhl1P63157 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Barhl1P63157 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Barhl1P63157 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Barhl1P63157 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Barhl1P63157 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Barhl1P63157 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Barhl1P63157 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Barhl1P63157 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Barhl1P63157 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Barhl1P63157 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Barhl1P63157 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Barhl1P63157 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Barhl1P63157 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Barhl1P63157 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Barhl1P63157 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Barhl1P63157 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Barhl1P63157 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Barhl1P63157 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Barhl1P63157 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Barhl1P63157 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Barhl1P63157 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Barhl1P63157 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Barhl1P63157 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Barhl1P63157 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Barhl1P63157 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Barhl1P63157 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Barhl1P63157 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Barhl1P63157 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Barhl1P63157 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Barhl1P63157 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Barhl1P63157 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Barhl1P63157 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Barhl1P63157 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Barhl1P63157 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Barhl1P63157 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms