Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl23P62830 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl23P62830 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl23P62830 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl23P62830 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl23P62830 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl23P62830 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl23P62830 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl23P62830 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl23P62830 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl23P62830 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl23P62830 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl23P62830 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl23P62830 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl23P62830 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl23P62830 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl23P62830 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl23P62830 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl23P62830 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl23P62830 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl23P62830 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl23P62830 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl23P62830 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl23P62830 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl23P62830 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl23P62830 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl23P62830 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl23P62830 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl23P62830 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl23P62830 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl23P62830 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl23P62830 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl23P62830 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl23P62830 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl23P62830 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl23P62830 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl23P62830 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl23P62830 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl23P62830 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl23P62830 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl23P62830 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl23P62830 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl23P62830 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl23P62830 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl23P62830 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl23P62830 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl23P62830 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl23P62830 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl23P62830 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl23P62830 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl23P62830 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl23P62830 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl23P62830 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl23P62830 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl23P62830 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl23P62830 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl23P62830 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl23P62830 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl23P62830 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl23P62830 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl23P62830 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl23P62830 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl23P62830 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpl23P62830 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl23P62830 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl23P62830 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl23P62830 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl23P62830 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpl23P62830 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl23P62830 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl23P62830 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl23P62830 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl23P62830 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpl23P62830 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl23P62830 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpl23P62830 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpl23P62830 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpl23P62830 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpl23P62830 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpl23P62830 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpl23P62830 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpl23P62830 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpl23P62830 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpl23P62830 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpl23P62830 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpl23P62830 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpl23P62830 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rpl23P62830 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpl23P62830 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpl23P62830 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpl23P62830 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpl23P62830 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpl23P62830 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpl23P62830 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpl23P62830 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpl23P62830 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpl23P62830 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpl23P62830 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpl23P62830 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpl23P62830 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms