Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcbp4P57724 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcbp4P57724 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcbp4P57724 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcbp4P57724 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcbp4P57724 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcbp4P57724 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcbp4P57724 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcbp4P57724 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcbp4P57724 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcbp4P57724 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcbp4P57724 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcbp4P57724 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcbp4P57724 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcbp4P57724 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcbp4P57724 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcbp4P57724 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcbp4P57724 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcbp4P57724 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pcbp4P57724 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcbp4P57724 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcbp4P57724 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcbp4P57724 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcbp4P57724 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcbp4P57724 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcbp4P57724 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcbp4P57724 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcbp4P57724 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcbp4P57724 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcbp4P57724 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcbp4P57724 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcbp4P57724 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcbp4P57724 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcbp4P57724 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcbp4P57724 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcbp4P57724 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcbp4P57724 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcbp4P57724 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcbp4P57724 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcbp4P57724 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcbp4P57724 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcbp4P57724 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcbp4P57724 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcbp4P57724 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcbp4P57724 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcbp4P57724 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcbp4P57724 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcbp4P57724 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcbp4P57724 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcbp4P57724 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcbp4P57724 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcbp4P57724 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcbp4P57724 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcbp4P57724 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcbp4P57724 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcbp4P57724 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcbp4P57724 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcbp4P57724 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcbp4P57724 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcbp4P57724 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcbp4P57724 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcbp4P57724 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcbp4P57724 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcbp4P57724 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcbp4P57724 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcbp4P57724 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcbp4P57724 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcbp4P57724 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcbp4P57724 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcbp4P57724 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcbp4P57724 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcbp4P57724 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcbp4P57724 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcbp4P57724 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcbp4P57724 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcbp4P57724 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcbp4P57724 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcbp4P57724 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcbp4P57724 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcbp4P57724 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcbp4P57724 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcbp4P57724 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcbp4P57724 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcbp4P57724 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcbp4P57724 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcbp4P57724 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcbp4P57724 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcbp4P57724 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcbp4P57724 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcbp4P57724 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcbp4P57724 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcbp4P57724 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcbp4P57724 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcbp4P57724 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcbp4P57724 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcbp4P57724 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcbp4P57724 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcbp4P57724 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcbp4P57724 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcbp4P57724 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms