Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NrlP54846 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NrlP54846 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NrlP54846 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NrlP54846 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NrlP54846 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NrlP54846 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NrlP54846 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NrlP54846 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NrlP54846 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NrlP54846 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NrlP54846 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NrlP54846 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NrlP54846 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NrlP54846 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NrlP54846 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NrlP54846 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NrlP54846 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NrlP54846 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NrlP54846 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NrlP54846 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NrlP54846 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NrlP54846 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NrlP54846 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NrlP54846 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NrlP54846 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NrlP54846 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NrlP54846 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NrlP54846 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NrlP54846 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NrlP54846 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NrlP54846 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NrlP54846 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NrlP54846 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NrlP54846 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NrlP54846 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NrlP54846 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NrlP54846 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NrlP54846 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NrlP54846 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NrlP54846 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NrlP54846 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NrlP54846 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NrlP54846 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NrlP54846 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NrlP54846 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NrlP54846 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NrlP54846 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NrlP54846 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NrlP54846 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NrlP54846 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NrlP54846 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NrlP54846 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NrlP54846 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NrlP54846 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NrlP54846 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NrlP54846 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NrlP54846 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NrlP54846 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NrlP54846 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NrlP54846 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NrlP54846 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NrlP54846 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NrlP54846 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NrlP54846 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NrlP54846 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NrlP54846 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NrlP54846 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NrlP54846 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NrlP54846 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NrlP54846 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NrlP54846 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NrlP54846 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NrlP54846 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NrlP54846 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NrlP54846 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NrlP54846 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NrlP54846 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NrlP54846 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NrlP54846 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NrlP54846 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NrlP54846 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NrlP54846 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NrlP54846 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NrlP54846 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NrlP54846 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NrlP54846 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NrlP54846 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NrlP54846 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NrlP54846 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NrlP54846 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NrlP54846 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NrlP54846 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NrlP54846 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NrlP54846 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NrlP54846 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NrlP54846 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NrlP54846 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NrlP54846 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NrlP54846 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms