Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnnt2P50752 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnnt2P50752 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnnt2P50752 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnnt2P50752 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Tnnt2P50752 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnnt2P50752 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnnt2P50752 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tnnt2P50752 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tnnt2P50752 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tnnt2P50752 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tnnt2P50752 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tnnt2P50752 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Tnnt2P50752 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Tnnt2P50752 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tnnt2P50752 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tnnt2P50752 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tnnt2P50752 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tnnt2P50752 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tnnt2P50752 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnnt2P50752 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnnt2P50752 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Tnnt2P50752 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tnnt2P50752 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tnnt2P50752 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tnnt2P50752 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tnnt2P50752 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnnt2P50752 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnnt2P50752 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tnnt2P50752 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnnt2P50752 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tnnt2P50752 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnnt2P50752 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tnnt2P50752 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tnnt2P50752 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tnnt2P50752 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tnnt2P50752 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tnnt2P50752 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tnnt2P50752 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnnt2P50752 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnnt2P50752 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnnt2P50752 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnnt2P50752 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tnnt2P50752 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tnnt2P50752 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnnt2P50752 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnnt2P50752 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnnt2P50752 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnnt2P50752 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnnt2P50752 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnnt2P50752 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnnt2P50752 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnnt2P50752 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnnt2P50752 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnnt2P50752 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnnt2P50752 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tnnt2P50752 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tnnt2P50752 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnnt2P50752 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnnt2P50752 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnnt2P50752 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tnnt2P50752 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnnt2P50752 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnnt2P50752 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnnt2P50752 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnnt2P50752 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tnnt2P50752 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnnt2P50752 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnnt2P50752 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tnnt2P50752 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnnt2P50752 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnnt2P50752 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnnt2P50752 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnnt2P50752 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnnt2P50752 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnnt2P50752 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnnt2P50752 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnnt2P50752 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnnt2P50752 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnnt2P50752 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnnt2P50752 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnnt2P50752 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnnt2P50752 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnnt2P50752 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnnt2P50752 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tnnt2P50752 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnnt2P50752 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnnt2P50752 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnnt2P50752 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnnt2P50752 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnnt2P50752 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnnt2P50752 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnnt2P50752 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnnt2P50752 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnnt2P50752 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnnt2P50752 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tnnt2P50752 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tnnt2P50752 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnnt2P50752 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnnt2P50752 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms