Protein–RNA interactions for Protein: P43688

Nkx2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-6P43688 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx2-6P43688 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx2-6P43688 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx2-6P43688 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nkx2-6P43688 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nkx2-6P43688 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nkx2-6P43688 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nkx2-6P43688 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx2-6P43688 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx2-6P43688 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nkx2-6P43688 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nkx2-6P43688 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx2-6P43688 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx2-6P43688 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx2-6P43688 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx2-6P43688 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx2-6P43688 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-6P43688 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-6P43688 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-6P43688 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx2-6P43688 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx2-6P43688 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx2-6P43688 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx2-6P43688 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx2-6P43688 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx2-6P43688 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx2-6P43688 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx2-6P43688 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nkx2-6P43688 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx2-6P43688 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx2-6P43688 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx2-6P43688 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx2-6P43688 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx2-6P43688 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx2-6P43688 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx2-6P43688 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx2-6P43688 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx2-6P43688 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx2-6P43688 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nkx2-6P43688 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nkx2-6P43688 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nkx2-6P43688 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx2-6P43688 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx2-6P43688 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx2-6P43688 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx2-6P43688 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx2-6P43688 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx2-6P43688 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx2-6P43688 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx2-6P43688 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx2-6P43688 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx2-6P43688 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx2-6P43688 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx2-6P43688 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx2-6P43688 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx2-6P43688 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx2-6P43688 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx2-6P43688 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx2-6P43688 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx2-6P43688 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx2-6P43688 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx2-6P43688 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx2-6P43688 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx2-6P43688 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx2-6P43688 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nkx2-6P43688 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx2-6P43688 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx2-6P43688 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx2-6P43688 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx2-6P43688 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx2-6P43688 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx2-6P43688 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx2-6P43688 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx2-6P43688 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx2-6P43688 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx2-6P43688 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx2-6P43688 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx2-6P43688 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx2-6P43688 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx2-6P43688 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx2-6P43688 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nkx2-6P43688 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx2-6P43688 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx2-6P43688 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx2-6P43688 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx2-6P43688 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx2-6P43688 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx2-6P43688 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx2-6P43688 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx2-6P43688 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx2-6P43688 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx2-6P43688 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx2-6P43688 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx2-6P43688 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx2-6P43688 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx2-6P43688 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx2-6P43688 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx2-6P43688 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx2-6P43688 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx2-6P43688 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms