Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
PtprkP35822 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
PtprkP35822 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
PtprkP35822 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
PtprkP35822 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
PtprkP35822 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
PtprkP35822 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC43.78■■■■■ 4.6
PtprkP35822 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
PtprkP35822 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
PtprkP35822 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
PtprkP35822 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
PtprkP35822 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
PtprkP35822 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
PtprkP35822 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
PtprkP35822 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
PtprkP35822 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
PtprkP35822 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC43.71■■■■■ 4.59
PtprkP35822 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
PtprkP35822 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
PtprkP35822 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
PtprkP35822 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC43.68■■■■■ 4.58
PtprkP35822 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
PtprkP35822 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
PtprkP35822 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
PtprkP35822 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
PtprkP35822 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
PtprkP35822 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
PtprkP35822 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
PtprkP35822 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
PtprkP35822 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
PtprkP35822 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
PtprkP35822 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
PtprkP35822 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC43.35■■■■■ 4.53
PtprkP35822 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
PtprkP35822 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
PtprkP35822 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
PtprkP35822 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
PtprkP35822 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
PtprkP35822 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
PtprkP35822 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
PtprkP35822 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
PtprkP35822 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
PtprkP35822 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
PtprkP35822 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
PtprkP35822 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
PtprkP35822 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
PtprkP35822 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC43.19■■■■■ 4.51
PtprkP35822 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
PtprkP35822 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
PtprkP35822 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
PtprkP35822 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
PtprkP35822 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
PtprkP35822 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
PtprkP35822 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
PtprkP35822 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
PtprkP35822 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
PtprkP35822 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
PtprkP35822 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
PtprkP35822 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
PtprkP35822 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
PtprkP35822 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
PtprkP35822 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
PtprkP35822 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
PtprkP35822 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
PtprkP35822 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
PtprkP35822 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC42.95■■■■■ 4.47
PtprkP35822 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC42.95■■■■■ 4.47
PtprkP35822 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
PtprkP35822 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
PtprkP35822 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
PtprkP35822 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
PtprkP35822 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.45
PtprkP35822 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
PtprkP35822 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
PtprkP35822 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
PtprkP35822 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
PtprkP35822 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
PtprkP35822 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
PtprkP35822 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
PtprkP35822 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
PtprkP35822 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
PtprkP35822 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
PtprkP35822 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
PtprkP35822 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
PtprkP35822 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC42.7■■■■■ 4.43
PtprkP35822 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
PtprkP35822 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC42.6■■■■■ 4.41
PtprkP35822 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
PtprkP35822 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
PtprkP35822 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC42.51■■■■■ 4.4
PtprkP35822 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
PtprkP35822 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
PtprkP35822 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
PtprkP35822 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
PtprkP35822 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
PtprkP35822 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
PtprkP35822 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
PtprkP35822 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
PtprkP35822 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
PtprkP35822 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms