Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rab23P35288 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rab23P35288 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rab23P35288 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab23P35288 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab23P35288 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rab23P35288 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rab23P35288 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab23P35288 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rab23P35288 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rab23P35288 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rab23P35288 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rab23P35288 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab23P35288 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab23P35288 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab23P35288 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Rab23P35288 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab23P35288 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rab23P35288 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rab23P35288 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rab23P35288 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rab23P35288 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rab23P35288 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rab23P35288 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rab23P35288 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rab23P35288 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rab23P35288 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rab23P35288 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rab23P35288 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rab23P35288 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rab23P35288 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rab23P35288 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rab23P35288 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rab23P35288 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rab23P35288 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rab23P35288 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rab23P35288 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rab23P35288 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rab23P35288 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rab23P35288 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rab23P35288 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rab23P35288 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rab23P35288 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rab23P35288 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rab23P35288 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rab23P35288 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rab23P35288 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rab23P35288 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rab23P35288 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rab23P35288 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rab23P35288 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rab23P35288 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rab23P35288 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rab23P35288 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rab23P35288 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rab23P35288 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rab23P35288 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rab23P35288 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rab23P35288 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rab23P35288 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rab23P35288 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rab23P35288 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rab23P35288 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rab23P35288 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rab23P35288 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rab23P35288 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rab23P35288 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rab23P35288 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rab23P35288 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab23P35288 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab23P35288 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rab23P35288 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab23P35288 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab23P35288 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab23P35288 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab23P35288 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rab23P35288 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab23P35288 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rab23P35288 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab23P35288 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab23P35288 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab23P35288 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab23P35288 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab23P35288 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab23P35288 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab23P35288 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab23P35288 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab23P35288 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab23P35288 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab23P35288 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab23P35288 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab23P35288 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab23P35288 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab23P35288 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab23P35288 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Rab23P35288 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab23P35288 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab23P35288 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab23P35288 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab23P35288 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms