Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Rab21P35282 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Rab21P35282 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Rab21P35282 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rab21P35282 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rab21P35282 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rab21P35282 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Rab21P35282 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Rab21P35282 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Rab21P35282 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Rab21P35282 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Rab21P35282 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Rab21P35282 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Rab21P35282 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Rab21P35282 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Rab21P35282 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Rab21P35282 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Rab21P35282 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Rab21P35282 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Rab21P35282 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Rab21P35282 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rab21P35282 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Rab21P35282 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,61■■□□□ 1,69
Rab21P35282 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Rab21P35282 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Rab21P35282 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Rab21P35282 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Rab21P35282 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Rab21P35282 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Rab21P35282 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Rab21P35282 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Rab21P35282 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rab21P35282 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rab21P35282 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rab21P35282 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rab21P35282 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rab21P35282 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rab21P35282 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rab21P35282 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Rab21P35282 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Rab21P35282 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Rab21P35282 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Rab21P35282 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Rab21P35282 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Rab21P35282 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Rab21P35282 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Rab21P35282 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Rab21P35282 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Rab21P35282 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,38■■□□□ 1,65
Rab21P35282 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Rab21P35282 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rab21P35282 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rab21P35282 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rab21P35282 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Rab21P35282 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Rab21P35282 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Rab21P35282 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Rab21P35282 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Rab21P35282 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Rab21P35282 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Rab21P35282 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Rab21P35282 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Rab21P35282 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Rab21P35282 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Rab21P35282 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Rab21P35282 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Rab21P35282 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Rab21P35282 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Rab21P35282 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Rab21P35282 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Rab21P35282 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Rab21P35282 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Rab21P35282 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Rab21P35282 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Rab21P35282 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Rab21P35282 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Rab21P35282 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Rab21P35282 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Rab21P35282 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Rab21P35282 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25,13■■□□□ 1,61
Rab21P35282 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Rab21P35282 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Rab21P35282 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Rab21P35282 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Rab21P35282 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Rab21P35282 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Rab21P35282 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Rab21P35282 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Rab21P35282 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Rab21P35282 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Rab21P35282 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Rab21P35282 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Rab21P35282 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Rab21P35282 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Rab21P35282 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Rab21P35282 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Rab21P35282 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Rab21P35282 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Rab21P35282 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Rab21P35282 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53,1 ms