Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ptpn11P35235 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ptpn11P35235 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ptpn11P35235 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ptpn11P35235 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ptpn11P35235 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ptpn11P35235 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ptpn11P35235 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ptpn11P35235 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ptpn11P35235 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ptpn11P35235 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Ptpn11P35235 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ptpn11P35235 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ptpn11P35235 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ptpn11P35235 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ptpn11P35235 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ptpn11P35235 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ptpn11P35235 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ptpn11P35235 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ptpn11P35235 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ptpn11P35235 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ptpn11P35235 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ptpn11P35235 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ptpn11P35235 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ptpn11P35235 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ptpn11P35235 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ptpn11P35235 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ptpn11P35235 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ptpn11P35235 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ptpn11P35235 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ptpn11P35235 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ptpn11P35235 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ptpn11P35235 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ptpn11P35235 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ptpn11P35235 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ptpn11P35235 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ptpn11P35235 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ptpn11P35235 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ptpn11P35235 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ptpn11P35235 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ptpn11P35235 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ptpn11P35235 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ptpn11P35235 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ptpn11P35235 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ptpn11P35235 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ptpn11P35235 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ptpn11P35235 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ptpn11P35235 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ptpn11P35235 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ptpn11P35235 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ptpn11P35235 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ptpn11P35235 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ptpn11P35235 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ptpn11P35235 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ptpn11P35235 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ptpn11P35235 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ptpn11P35235 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ptpn11P35235 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ptpn11P35235 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ptpn11P35235 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ptpn11P35235 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ptpn11P35235 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ptpn11P35235 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ptpn11P35235 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ptpn11P35235 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ptpn11P35235 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ptpn11P35235 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ptpn11P35235 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ptpn11P35235 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ptpn11P35235 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ptpn11P35235 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ptpn11P35235 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ptpn11P35235 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ptpn11P35235 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ptpn11P35235 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ptpn11P35235 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ptpn11P35235 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ptpn11P35235 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ptpn11P35235 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ptpn11P35235 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ptpn11P35235 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ptpn11P35235 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ptpn11P35235 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ptpn11P35235 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ptpn11P35235 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ptpn11P35235 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ptpn11P35235 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ptpn11P35235 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ptpn11P35235 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ptpn11P35235 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ptpn11P35235 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ptpn11P35235 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ptpn11P35235 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ptpn11P35235 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ptpn11P35235 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ptpn11P35235 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ptpn11P35235 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptpn11P35235 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptpn11P35235 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptpn11P35235 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms