Protein–RNA interactions for Protein: P31725

S100a9, Protein S100-A9, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100a9P31725 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
S100a9P31725 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
S100a9P31725 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
S100a9P31725 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
S100a9P31725 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
S100a9P31725 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
S100a9P31725 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
S100a9P31725 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
S100a9P31725 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
S100a9P31725 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
S100a9P31725 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
S100a9P31725 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
S100a9P31725 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
S100a9P31725 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S100a9P31725 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S100a9P31725 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S100a9P31725 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
S100a9P31725 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
S100a9P31725 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
S100a9P31725 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
S100a9P31725 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
S100a9P31725 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
S100a9P31725 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
S100a9P31725 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
S100a9P31725 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
S100a9P31725 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
S100a9P31725 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
S100a9P31725 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
S100a9P31725 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
S100a9P31725 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
S100a9P31725 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
S100a9P31725 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
S100a9P31725 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
S100a9P31725 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
S100a9P31725 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
S100a9P31725 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
S100a9P31725 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S100a9P31725 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S100a9P31725 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S100a9P31725 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
S100a9P31725 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
S100a9P31725 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
S100a9P31725 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
S100a9P31725 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
S100a9P31725 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
S100a9P31725 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S100a9P31725 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
S100a9P31725 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S100a9P31725 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
S100a9P31725 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
S100a9P31725 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
S100a9P31725 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S100a9P31725 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
S100a9P31725 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S100a9P31725 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S100a9P31725 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S100a9P31725 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
S100a9P31725 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
S100a9P31725 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
S100a9P31725 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
S100a9P31725 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S100a9P31725 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
S100a9P31725 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S100a9P31725 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
S100a9P31725 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
S100a9P31725 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
S100a9P31725 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
S100a9P31725 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S100a9P31725 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S100a9P31725 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
S100a9P31725 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
S100a9P31725 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
S100a9P31725 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
S100a9P31725 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
S100a9P31725 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
S100a9P31725 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
S100a9P31725 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
S100a9P31725 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
S100a9P31725 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
S100a9P31725 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
S100a9P31725 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S100a9P31725 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S100a9P31725 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S100a9P31725 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
S100a9P31725 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
S100a9P31725 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
S100a9P31725 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S100a9P31725 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S100a9P31725 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S100a9P31725 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S100a9P31725 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
S100a9P31725 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
S100a9P31725 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
S100a9P31725 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
S100a9P31725 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
S100a9P31725 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
S100a9P31725 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S100a9P31725 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S100a9P31725 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S100a9P31725 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms