Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccnd3P30282 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccnd3P30282 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccnd3P30282 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccnd3P30282 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccnd3P30282 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccnd3P30282 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccnd3P30282 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccnd3P30282 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccnd3P30282 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccnd3P30282 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccnd3P30282 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccnd3P30282 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccnd3P30282 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccnd3P30282 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccnd3P30282 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccnd3P30282 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccnd3P30282 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccnd3P30282 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccnd3P30282 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccnd3P30282 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccnd3P30282 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccnd3P30282 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccnd3P30282 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccnd3P30282 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccnd3P30282 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccnd3P30282 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccnd3P30282 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccnd3P30282 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccnd3P30282 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccnd3P30282 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccnd3P30282 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccnd3P30282 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccnd3P30282 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccnd3P30282 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccnd3P30282 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccnd3P30282 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccnd3P30282 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccnd3P30282 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccnd3P30282 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccnd3P30282 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccnd3P30282 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccnd3P30282 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccnd3P30282 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccnd3P30282 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccnd3P30282 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccnd3P30282 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccnd3P30282 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccnd3P30282 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccnd3P30282 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccnd3P30282 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccnd3P30282 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccnd3P30282 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccnd3P30282 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccnd3P30282 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccnd3P30282 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccnd3P30282 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccnd3P30282 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccnd3P30282 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccnd3P30282 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccnd3P30282 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccnd3P30282 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccnd3P30282 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccnd3P30282 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccnd3P30282 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccnd3P30282 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccnd3P30282 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccnd3P30282 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccnd3P30282 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccnd3P30282 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccnd3P30282 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccnd3P30282 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccnd3P30282 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccnd3P30282 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccnd3P30282 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ccnd3P30282 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccnd3P30282 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccnd3P30282 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccnd3P30282 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccnd3P30282 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccnd3P30282 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccnd3P30282 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccnd3P30282 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccnd3P30282 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccnd3P30282 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccnd3P30282 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccnd3P30282 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccnd3P30282 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccnd3P30282 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccnd3P30282 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccnd3P30282 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccnd3P30282 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccnd3P30282 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccnd3P30282 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccnd3P30282 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccnd3P30282 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccnd3P30282 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccnd3P30282 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccnd3P30282 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccnd3P30282 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms