Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,98
PtprmP28828 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC39,88■■■■□ 3,97
PtprmP28828 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC39,87■■■■□ 3,97
PtprmP28828 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC39,82■■■■□ 3,97
PtprmP28828 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC39,81■■■■□ 3,96
PtprmP28828 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,81■■■■□ 3,96
PtprmP28828 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,8■■■■□ 3,96
PtprmP28828 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,79■■■■□ 3,96
PtprmP28828 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC39,79■■■■□ 3,96
PtprmP28828 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39,78■■■■□ 3,96
PtprmP28828 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,77■■■■□ 3,96
PtprmP28828 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39,74■■■■□ 3,95
PtprmP28828 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC39,74■■■■□ 3,95
PtprmP28828 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC39,74■■■■□ 3,95
PtprmP28828 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,72■■■■□ 3,95
PtprmP28828 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,7■■■■□ 3,95
PtprmP28828 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC39,68■■■■□ 3,94
PtprmP28828 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC39,66■■■■□ 3,94
PtprmP28828 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,65■■■■□ 3,94
PtprmP28828 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39,65■■■■□ 3,94
PtprmP28828 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,64■■■■□ 3,94
PtprmP28828 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,63■■■■□ 3,94
PtprmP28828 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,62■■■■□ 3,93
PtprmP28828 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,62■■■■□ 3,93
PtprmP28828 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC39,58■■■■□ 3,93
PtprmP28828 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,57■■■■□ 3,92
PtprmP28828 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC39,56■■■■□ 3,92
PtprmP28828 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC39,52■■■■□ 3,92
PtprmP28828 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39,52■■■■□ 3,92
PtprmP28828 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC39,5■■■■□ 3,91
PtprmP28828 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
PtprmP28828 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC39,43■■■■□ 3,9
PtprmP28828 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39,42■■■■□ 3,9
PtprmP28828 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC39,42■■■■□ 3,9
PtprmP28828 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
PtprmP28828 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,37■■■■□ 3,89
PtprmP28828 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC39,37■■■■□ 3,89
PtprmP28828 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC39,34■■■■□ 3,89
PtprmP28828 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC39,34■■■■□ 3,89
PtprmP28828 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC39,34■■■■□ 3,89
PtprmP28828 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,33■■■■□ 3,89
PtprmP28828 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC39,28■■■■□ 3,88
PtprmP28828 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC39,24■■■■□ 3,87
PtprmP28828 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC39,22■■■■□ 3,87
PtprmP28828 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,17■■■■□ 3,86
PtprmP28828 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,12■■■■□ 3,85
PtprmP28828 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC39,12■■■■□ 3,85
PtprmP28828 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,09■■■■□ 3,85
PtprmP28828 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,07■■■■□ 3,85
PtprmP28828 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC39,06■■■■□ 3,84
PtprmP28828 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC39,02■■■■□ 3,84
PtprmP28828 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC39,01■■■■□ 3,84
PtprmP28828 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,98■■■■□ 3,83
PtprmP28828 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC38,97■■■■□ 3,83
PtprmP28828 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC38,91■■■■□ 3,82
PtprmP28828 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,9■■■■□ 3,82
PtprmP28828 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC38,9■■■■□ 3,82
PtprmP28828 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
PtprmP28828 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC38,87■■■■□ 3,81
PtprmP28828 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,86■■■■□ 3,81
PtprmP28828 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC38,85■■■■□ 3,81
PtprmP28828 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
PtprmP28828 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,81
PtprmP28828 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,8■■■■□ 3,8
PtprmP28828 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC38,8■■■■□ 3,8
PtprmP28828 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC38,79■■■■□ 3,8
PtprmP28828 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,79■■■■□ 3,8
PtprmP28828 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,78■■■■□ 3,8
PtprmP28828 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
PtprmP28828 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
PtprmP28828 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,69■■■■□ 3,78
PtprmP28828 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,66■■■■□ 3,78
PtprmP28828 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,65■■■■□ 3,78
PtprmP28828 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC38,61■■■■□ 3,77
PtprmP28828 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC38,6■■■■□ 3,77
PtprmP28828 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,77
PtprmP28828 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC38,48■■■■□ 3,75
PtprmP28828 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38,47■■■■□ 3,75
PtprmP28828 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38,43■■■■□ 3,74
PtprmP28828 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38,41■■■■□ 3,74
PtprmP28828 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC38,38■■■■□ 3,73
PtprmP28828 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
PtprmP28828 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
PtprmP28828 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC38,31■■■■□ 3,72
PtprmP28828 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC38,3■■■■□ 3,72
PtprmP28828 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,27■■■■□ 3,72
PtprmP28828 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,27■■■■□ 3,72
PtprmP28828 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,25■■■■□ 3,71
PtprmP28828 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC38,25■■■■□ 3,71
PtprmP28828 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC38,24■■■■□ 3,71
PtprmP28828 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38,23■■■■□ 3,71
PtprmP28828 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,23■■■■□ 3,71
PtprmP28828 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC38,22■■■■□ 3,71
PtprmP28828 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC38,21■■■■□ 3,71
PtprmP28828 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
PtprmP28828 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,2■■■■□ 3,71
PtprmP28828 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
PtprmP28828 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC38,17■■■■□ 3,7
PtprmP28828 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC38,16■■■■□ 3,7
PtprmP28828 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38,16■■■■□ 3,7
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