Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa3P28310 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa3P28310 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa3P28310 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa3P28310 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa3P28310 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa3P28310 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa3P28310 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa3P28310 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa3P28310 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa3P28310 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa3P28310 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa3P28310 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa3P28310 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa3P28310 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa3P28310 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa3P28310 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa3P28310 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa3P28310 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa3P28310 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa3P28310 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa3P28310 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa3P28310 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa3P28310 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa3P28310 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa3P28310 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa3P28310 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa3P28310 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa3P28310 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa3P28310 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa3P28310 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa3P28310 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa3P28310 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa3P28310 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa3P28310 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa3P28310 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa3P28310 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa3P28310 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa3P28310 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa3P28310 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa3P28310 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa3P28310 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa3P28310 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa3P28310 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa3P28310 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa3P28310 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa3P28310 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa3P28310 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa3P28310 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa3P28310 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa3P28310 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa3P28310 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa3P28310 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa3P28310 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa3P28310 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa3P28310 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa3P28310 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa3P28310 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa3P28310 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa3P28310 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa3P28310 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa3P28310 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa3P28310 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa3P28310 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa3P28310 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa3P28310 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa3P28310 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa3P28310 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa3P28310 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa3P28310 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa3P28310 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa3P28310 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa3P28310 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Defa3P28310 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Defa3P28310 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa3P28310 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa3P28310 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa3P28310 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa3P28310 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa3P28310 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa3P28310 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa3P28310 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa3P28310 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa3P28310 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa3P28310 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa3P28310 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa3P28310 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa3P28310 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa3P28310 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa3P28310 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa3P28310 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa3P28310 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa3P28310 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa3P28310 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa3P28310 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa3P28310 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa3P28310 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa3P28310 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa3P28310 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa3P28310 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms