Protein–RNA interactions for Protein: P26516

Psmd7, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd7P26516 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd7P26516 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd7P26516 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd7P26516 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd7P26516 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd7P26516 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd7P26516 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd7P26516 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd7P26516 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd7P26516 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd7P26516 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmd7P26516 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmd7P26516 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmd7P26516 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmd7P26516 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmd7P26516 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd7P26516 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd7P26516 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd7P26516 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd7P26516 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd7P26516 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmd7P26516 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmd7P26516 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd7P26516 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd7P26516 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd7P26516 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd7P26516 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd7P26516 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd7P26516 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psmd7P26516 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd7P26516 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd7P26516 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd7P26516 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd7P26516 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd7P26516 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd7P26516 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd7P26516 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd7P26516 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd7P26516 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd7P26516 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd7P26516 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Psmd7P26516 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd7P26516 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd7P26516 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd7P26516 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd7P26516 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd7P26516 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd7P26516 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd7P26516 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd7P26516 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmd7P26516 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd7P26516 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd7P26516 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmd7P26516 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd7P26516 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd7P26516 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd7P26516 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd7P26516 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd7P26516 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd7P26516 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd7P26516 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd7P26516 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd7P26516 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd7P26516 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd7P26516 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmd7P26516 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psmd7P26516 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psmd7P26516 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd7P26516 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd7P26516 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd7P26516 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd7P26516 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd7P26516 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd7P26516 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd7P26516 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd7P26516 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd7P26516 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd7P26516 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Psmd7P26516 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd7P26516 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd7P26516 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd7P26516 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd7P26516 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd7P26516 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd7P26516 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd7P26516 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd7P26516 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd7P26516 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd7P26516 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd7P26516 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd7P26516 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd7P26516 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd7P26516 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd7P26516 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd7P26516 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd7P26516 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd7P26516 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd7P26516 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd7P26516 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd7P26516 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms