Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
ChgaP26339 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,98■■■□□ 2,71
ChgaP26339 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,98■■■□□ 2,71
ChgaP26339 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
ChgaP26339 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
ChgaP26339 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
ChgaP26339 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31,94■■■□□ 2,7
ChgaP26339 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
ChgaP26339 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
ChgaP26339 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
ChgaP26339 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,9■■■□□ 2,7
ChgaP26339 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31,9■■■□□ 2,7
ChgaP26339 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
ChgaP26339 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
ChgaP26339 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31,88■■■□□ 2,69
ChgaP26339 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
ChgaP26339 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
ChgaP26339 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,83■■■□□ 2,69
ChgaP26339 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
ChgaP26339 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
ChgaP26339 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
ChgaP26339 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
ChgaP26339 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
ChgaP26339 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
ChgaP26339 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
ChgaP26339 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
ChgaP26339 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31,73■■■□□ 2,67
ChgaP26339 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,73■■■□□ 2,67
ChgaP26339 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC31,72■■■□□ 2,67
ChgaP26339 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
ChgaP26339 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,66
ChgaP26339 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
ChgaP26339 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
ChgaP26339 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31,66■■■□□ 2,66
ChgaP26339 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
ChgaP26339 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
ChgaP26339 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
ChgaP26339 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
ChgaP26339 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31,62■■■□□ 2,65
ChgaP26339 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
ChgaP26339 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
ChgaP26339 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
ChgaP26339 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
ChgaP26339 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31,54■■■□□ 2,64
ChgaP26339 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
ChgaP26339 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,52■■■□□ 2,64
ChgaP26339 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,51■■■□□ 2,64
ChgaP26339 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,5■■■□□ 2,63
ChgaP26339 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31,5■■■□□ 2,63
ChgaP26339 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,5■■■□□ 2,63
ChgaP26339 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31,47■■■□□ 2,63
ChgaP26339 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
ChgaP26339 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
ChgaP26339 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
ChgaP26339 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
ChgaP26339 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,45■■■□□ 2,62
ChgaP26339 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,45■■■□□ 2,62
ChgaP26339 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
ChgaP26339 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
ChgaP26339 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
ChgaP26339 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,44■■■□□ 2,62
ChgaP26339 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31,43■■■□□ 2,62
ChgaP26339 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31,42■■■□□ 2,62
ChgaP26339 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
ChgaP26339 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
ChgaP26339 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
ChgaP26339 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
ChgaP26339 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
ChgaP26339 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
ChgaP26339 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
ChgaP26339 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,33■■■□□ 2,61
ChgaP26339 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31,32■■■□□ 2,6
ChgaP26339 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
ChgaP26339 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,31■■■□□ 2,6
ChgaP26339 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,3■■■□□ 2,6
ChgaP26339 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,28■■■□□ 2,6
ChgaP26339 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
ChgaP26339 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31,27■■■□□ 2,6
ChgaP26339 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,26■■■□□ 2,59
ChgaP26339 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
ChgaP26339 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
ChgaP26339 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
ChgaP26339 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
ChgaP26339 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
ChgaP26339 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
ChgaP26339 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,2■■■□□ 2,59
ChgaP26339 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
ChgaP26339 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
ChgaP26339 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
ChgaP26339 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
ChgaP26339 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
ChgaP26339 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31,16■■■□□ 2,58
ChgaP26339 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
ChgaP26339 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
ChgaP26339 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
ChgaP26339 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31,1■■■□□ 2,57
ChgaP26339 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
ChgaP26339 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
ChgaP26339 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
ChgaP26339 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,7 ms