Protein–RNA interactions for Protein: P26039

Tln1, Talin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tln1P26039 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tln1P26039 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tln1P26039 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tln1P26039 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tln1P26039 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tln1P26039 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tln1P26039 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tln1P26039 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tln1P26039 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tln1P26039 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tln1P26039 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tln1P26039 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tln1P26039 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tln1P26039 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tln1P26039 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tln1P26039 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tln1P26039 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tln1P26039 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tln1P26039 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tln1P26039 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tln1P26039 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tln1P26039 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tln1P26039 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tln1P26039 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tln1P26039 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tln1P26039 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tln1P26039 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tln1P26039 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tln1P26039 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tln1P26039 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tln1P26039 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tln1P26039 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tln1P26039 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tln1P26039 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tln1P26039 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tln1P26039 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tln1P26039 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tln1P26039 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tln1P26039 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tln1P26039 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tln1P26039 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tln1P26039 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tln1P26039 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tln1P26039 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tln1P26039 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tln1P26039 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tln1P26039 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tln1P26039 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tln1P26039 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tln1P26039 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tln1P26039 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tln1P26039 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tln1P26039 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tln1P26039 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tln1P26039 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tln1P26039 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tln1P26039 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tln1P26039 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tln1P26039 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tln1P26039 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tln1P26039 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tln1P26039 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tln1P26039 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tln1P26039 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tln1P26039 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tln1P26039 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tln1P26039 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tln1P26039 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tln1P26039 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tln1P26039 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tln1P26039 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tln1P26039 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tln1P26039 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tln1P26039 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tln1P26039 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tln1P26039 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tln1P26039 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tln1P26039 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tln1P26039 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tln1P26039 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tln1P26039 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tln1P26039 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tln1P26039 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tln1P26039 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tln1P26039 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tln1P26039 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tln1P26039 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tln1P26039 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tln1P26039 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tln1P26039 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tln1P26039 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tln1P26039 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tln1P26039 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tln1P26039 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tln1P26039 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tln1P26039 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tln1P26039 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tln1P26039 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tln1P26039 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tln1P26039 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms