Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SftpcP21841 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SftpcP21841 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SftpcP21841 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SftpcP21841 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SftpcP21841 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SftpcP21841 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SftpcP21841 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SftpcP21841 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SftpcP21841 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SftpcP21841 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SftpcP21841 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SftpcP21841 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SftpcP21841 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SftpcP21841 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SftpcP21841 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SftpcP21841 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SftpcP21841 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SftpcP21841 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SftpcP21841 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SftpcP21841 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SftpcP21841 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SftpcP21841 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SftpcP21841 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SftpcP21841 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SftpcP21841 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SftpcP21841 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SftpcP21841 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SftpcP21841 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SftpcP21841 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SftpcP21841 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SftpcP21841 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SftpcP21841 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SftpcP21841 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SftpcP21841 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SftpcP21841 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SftpcP21841 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SftpcP21841 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SftpcP21841 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SftpcP21841 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SftpcP21841 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SftpcP21841 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SftpcP21841 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SftpcP21841 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SftpcP21841 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SftpcP21841 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SftpcP21841 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SftpcP21841 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SftpcP21841 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SftpcP21841 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SftpcP21841 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SftpcP21841 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SftpcP21841 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SftpcP21841 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SftpcP21841 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SftpcP21841 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SftpcP21841 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SftpcP21841 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SftpcP21841 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SftpcP21841 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SftpcP21841 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SftpcP21841 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SftpcP21841 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SftpcP21841 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SftpcP21841 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SftpcP21841 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SftpcP21841 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SftpcP21841 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SftpcP21841 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SftpcP21841 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SftpcP21841 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SftpcP21841 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SftpcP21841 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SftpcP21841 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SftpcP21841 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SftpcP21841 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SftpcP21841 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SftpcP21841 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SftpcP21841 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SftpcP21841 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SftpcP21841 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SftpcP21841 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SftpcP21841 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SftpcP21841 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SftpcP21841 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SftpcP21841 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SftpcP21841 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SftpcP21841 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SftpcP21841 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SftpcP21841 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SftpcP21841 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SftpcP21841 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SftpcP21841 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SftpcP21841 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SftpcP21841 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SftpcP21841 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SftpcP21841 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SftpcP21841 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SftpcP21841 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SftpcP21841 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms