Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga5P11688 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Itga5P11688 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga5P11688 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga5P11688 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga5P11688 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga5P11688 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga5P11688 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itga5P11688 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga5P11688 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga5P11688 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga5P11688 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga5P11688 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga5P11688 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga5P11688 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga5P11688 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga5P11688 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga5P11688 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga5P11688 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga5P11688 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga5P11688 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga5P11688 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga5P11688 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga5P11688 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga5P11688 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga5P11688 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga5P11688 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga5P11688 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga5P11688 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga5P11688 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itga5P11688 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itga5P11688 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itga5P11688 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga5P11688 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga5P11688 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itga5P11688 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itga5P11688 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga5P11688 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga5P11688 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga5P11688 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga5P11688 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga5P11688 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga5P11688 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga5P11688 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga5P11688 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga5P11688 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga5P11688 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga5P11688 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Itga5P11688 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga5P11688 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga5P11688 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga5P11688 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga5P11688 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga5P11688 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga5P11688 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga5P11688 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga5P11688 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga5P11688 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga5P11688 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga5P11688 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga5P11688 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga5P11688 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga5P11688 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga5P11688 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga5P11688 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga5P11688 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itga5P11688 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga5P11688 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga5P11688 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga5P11688 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga5P11688 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga5P11688 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga5P11688 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga5P11688 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga5P11688 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga5P11688 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga5P11688 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga5P11688 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga5P11688 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga5P11688 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga5P11688 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga5P11688 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga5P11688 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga5P11688 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga5P11688 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga5P11688 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga5P11688 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga5P11688 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga5P11688 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga5P11688 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga5P11688 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga5P11688 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga5P11688 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga5P11688 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga5P11688 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga5P11688 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga5P11688 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga5P11688 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga5P11688 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga5P11688 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.8 ms