Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Fgf4P11403 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21,17■□□□□ 0,98
Fgf4P11403 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Fgf4P11403 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Fgf4P11403 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21,15■□□□□ 0,98
Fgf4P11403 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Fgf4P11403 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Fgf4P11403 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Fgf4P11403 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Fgf4P11403 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Fgf4P11403 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Fgf4P11403 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Fgf4P11403 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Fgf4P11403 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Fgf4P11403 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Fgf4P11403 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Fgf4P11403 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Fgf4P11403 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21,02■□□□□ 0,96
Fgf4P11403 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,95
Fgf4P11403 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Fgf4P11403 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Fgf4P11403 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Fgf4P11403 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Fgf4P11403 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Fgf4P11403 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Fgf4P11403 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Fgf4P11403 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Fgf4P11403 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Fgf4P11403 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20,91■□□□□ 0,94
Fgf4P11403 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Fgf4P11403 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20,91■□□□□ 0,94
Fgf4P11403 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Fgf4P11403 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Fgf4P11403 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Fgf4P11403 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Fgf4P11403 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,93
Fgf4P11403 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Fgf4P11403 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Fgf4P11403 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Fgf4P11403 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Fgf4P11403 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Fgf4P11403 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Fgf4P11403 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20,86■□□□□ 0,93
Fgf4P11403 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Fgf4P11403 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Fgf4P11403 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20,85■□□□□ 0,93
Fgf4P11403 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Fgf4P11403 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Fgf4P11403 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Fgf4P11403 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Fgf4P11403 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Fgf4P11403 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Fgf4P11403 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Fgf4P11403 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Fgf4P11403 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Fgf4P11403 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Fgf4P11403 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Fgf4P11403 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20,72■□□□□ 0,91
Fgf4P11403 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Fgf4P11403 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Fgf4P11403 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Fgf4P11403 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Fgf4P11403 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Fgf4P11403 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Fgf4P11403 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Fgf4P11403 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Fgf4P11403 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Fgf4P11403 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20,68■□□□□ 0,9
Fgf4P11403 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Fgf4P11403 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Fgf4P11403 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Fgf4P11403 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Fgf4P11403 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20,66■□□□□ 0,9
Fgf4P11403 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Fgf4P11403 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Fgf4P11403 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Fgf4P11403 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,62■□□□□ 0,89
Fgf4P11403 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Fgf4P11403 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Fgf4P11403 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Fgf4P11403 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Fgf4P11403 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Fgf4P11403 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Fgf4P11403 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Fgf4P11403 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Fgf4P11403 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Fgf4P11403 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Fgf4P11403 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Fgf4P11403 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Fgf4P11403 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Fgf4P11403 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Fgf4P11403 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Fgf4P11403 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Fgf4P11403 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Fgf4P11403 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Fgf4P11403 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Fgf4P11403 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20,52■□□□□ 0,88
Fgf4P11403 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Fgf4P11403 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20,51■□□□□ 0,87
Fgf4P11403 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,6 ms