Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Ccl3P10855 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Ccl3P10855 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23,92■■□□□ 1,42
Ccl3P10855 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Ccl3P10855 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Ccl3P10855 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Ccl3P10855 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Ccl3P10855 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23,87■■□□□ 1,41
Ccl3P10855 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Ccl3P10855 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Ccl3P10855 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Ccl3P10855 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Ccl3P10855 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Ccl3P10855 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Ccl3P10855 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23,83■■□□□ 1,41
Ccl3P10855 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,4
Ccl3P10855 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Ccl3P10855 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23,8■■□□□ 1,4
Ccl3P10855 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Ccl3P10855 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23,76■■□□□ 1,39
Ccl3P10855 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23,76■■□□□ 1,39
Ccl3P10855 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Ccl3P10855 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Ccl3P10855 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Ccl3P10855 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Ccl3P10855 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ccl3P10855 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ccl3P10855 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Ccl3P10855 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Ccl3P10855 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Ccl3P10855 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Ccl3P10855 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Ccl3P10855 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ccl3P10855 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ccl3P10855 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Ccl3P10855 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Ccl3P10855 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Ccl3P10855 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Ccl3P10855 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Ccl3P10855 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23,58■■□□□ 1,37
Ccl3P10855 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Ccl3P10855 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Ccl3P10855 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Ccl3P10855 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Ccl3P10855 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Ccl3P10855 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Ccl3P10855 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Ccl3P10855 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Ccl3P10855 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Ccl3P10855 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23,5■■□□□ 1,35
Ccl3P10855 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Ccl3P10855 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Ccl3P10855 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Ccl3P10855 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23,46■■□□□ 1,35
Ccl3P10855 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Ccl3P10855 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Ccl3P10855 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Ccl3P10855 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ccl3P10855 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ccl3P10855 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ccl3P10855 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ccl3P10855 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ccl3P10855 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ccl3P10855 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Ccl3P10855 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Ccl3P10855 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ccl3P10855 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ccl3P10855 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23,4■■□□□ 1,34
Ccl3P10855 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Ccl3P10855 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Ccl3P10855 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Ccl3P10855 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Ccl3P10855 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ccl3P10855 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ccl3P10855 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Ccl3P10855 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Ccl3P10855 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Ccl3P10855 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Ccl3P10855 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Ccl3P10855 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ccl3P10855 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23,26■■□□□ 1,31
Ccl3P10855 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Ccl3P10855 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Ccl3P10855 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ccl3P10855 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ccl3P10855 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ccl3P10855 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ccl3P10855 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ccl3P10855 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ccl3P10855 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ccl3P10855 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Ccl3P10855 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Ccl3P10855 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23,2■■□□□ 1,3
Ccl3P10855 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Ccl3P10855 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Ccl3P10855 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Ccl3P10855 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Ccl3P10855 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Ccl3P10855 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Ccl3P10855 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,8 ms