Protein–RNA interactions for Protein: P0DM40

Fer1l5, Fer-1-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 2,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fer1l5P0DM40 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
Fer1l5P0DM40 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Fer1l5P0DM40 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Fer1l5P0DM40 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Fer1l5P0DM40 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Fer1l5P0DM40 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Fer1l5P0DM40 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Fer1l5P0DM40 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Fer1l5P0DM40 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Fer1l5P0DM40 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Fer1l5P0DM40 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Fer1l5P0DM40 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Fer1l5P0DM40 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Fer1l5P0DM40 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Fer1l5P0DM40 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Fer1l5P0DM40 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Fer1l5P0DM40 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Fer1l5P0DM40 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Fer1l5P0DM40 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Fer1l5P0DM40 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Fer1l5P0DM40 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Fer1l5P0DM40 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Fer1l5P0DM40 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Fer1l5P0DM40 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Fer1l5P0DM40 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Fer1l5P0DM40 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
Fer1l5P0DM40 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Fer1l5P0DM40 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Fer1l5P0DM40 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Fer1l5P0DM40 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Fer1l5P0DM40 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Fer1l5P0DM40 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Fer1l5P0DM40 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
Fer1l5P0DM40 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Fer1l5P0DM40 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Fer1l5P0DM40 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Fer1l5P0DM40 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Fer1l5P0DM40 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Fer1l5P0DM40 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Fer1l5P0DM40 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Fer1l5P0DM40 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Fer1l5P0DM40 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Fer1l5P0DM40 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Fer1l5P0DM40 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Fer1l5P0DM40 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Fer1l5P0DM40 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Fer1l5P0DM40 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
Fer1l5P0DM40 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Fer1l5P0DM40 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Fer1l5P0DM40 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Fer1l5P0DM40 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Fer1l5P0DM40 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Fer1l5P0DM40 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Fer1l5P0DM40 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Fer1l5P0DM40 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Fer1l5P0DM40 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Fer1l5P0DM40 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Fer1l5P0DM40 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Fer1l5P0DM40 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Fer1l5P0DM40 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Fer1l5P0DM40 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Fer1l5P0DM40 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Fer1l5P0DM40 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Fer1l5P0DM40 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Fer1l5P0DM40 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Fer1l5P0DM40 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Fer1l5P0DM40 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Fer1l5P0DM40 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Fer1l5P0DM40 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Fer1l5P0DM40 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Fer1l5P0DM40 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Fer1l5P0DM40 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Fer1l5P0DM40 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Fer1l5P0DM40 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Fer1l5P0DM40 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Fer1l5P0DM40 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Fer1l5P0DM40 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Fer1l5P0DM40 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Fer1l5P0DM40 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Fer1l5P0DM40 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Fer1l5P0DM40 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Fer1l5P0DM40 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Fer1l5P0DM40 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Fer1l5P0DM40 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Fer1l5P0DM40 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Fer1l5P0DM40 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Fer1l5P0DM40 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Fer1l5P0DM40 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Fer1l5P0DM40 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Fer1l5P0DM40 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Fer1l5P0DM40 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Fer1l5P0DM40 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Fer1l5P0DM40 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Fer1l5P0DM40 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Fer1l5P0DM40 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Fer1l5P0DM40 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Fer1l5P0DM40 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Fer1l5P0DM40 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Fer1l5P0DM40 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Fer1l5P0DM40 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36,3 ms