Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-K1P01901 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-K1P01901 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-K1P01901 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-K1P01901 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-K1P01901 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-K1P01901 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-K1P01901 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-K1P01901 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-K1P01901 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-K1P01901 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-K1P01901 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-K1P01901 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-K1P01901 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-K1P01901 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-K1P01901 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-K1P01901 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-K1P01901 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-K1P01901 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-K1P01901 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-K1P01901 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-K1P01901 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-K1P01901 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-K1P01901 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2-K1P01901 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-K1P01901 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-K1P01901 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-K1P01901 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-K1P01901 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-K1P01901 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-K1P01901 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-K1P01901 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-K1P01901 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-K1P01901 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-K1P01901 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-K1P01901 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-K1P01901 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-K1P01901 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-K1P01901 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-K1P01901 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-K1P01901 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-K1P01901 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-K1P01901 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-K1P01901 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-K1P01901 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-K1P01901 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-K1P01901 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-K1P01901 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-K1P01901 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-K1P01901 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-K1P01901 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-K1P01901 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-K1P01901 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-K1P01901 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-K1P01901 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-K1P01901 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-K1P01901 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-K1P01901 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-K1P01901 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-K1P01901 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-K1P01901 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-K1P01901 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-K1P01901 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-K1P01901 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-K1P01901 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-K1P01901 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-K1P01901 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-K1P01901 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-K1P01901 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-K1P01901 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-K1P01901 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-K1P01901 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-K1P01901 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-K1P01901 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-K1P01901 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-K1P01901 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-K1P01901 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-K1P01901 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-K1P01901 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-K1P01901 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-K1P01901 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-K1P01901 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-K1P01901 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-K1P01901 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-K1P01901 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-K1P01901 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-K1P01901 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-K1P01901 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-K1P01901 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-K1P01901 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-K1P01901 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-K1P01901 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-K1P01901 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-K1P01901 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-K1P01901 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-K1P01901 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-K1P01901 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-K1P01901 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-K1P01901 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-K1P01901 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms