Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
C4bP01029 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
C4bP01029 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
C4bP01029 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
C4bP01029 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
C4bP01029 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
C4bP01029 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
C4bP01029 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
C4bP01029 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
C4bP01029 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
C4bP01029 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
C4bP01029 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
C4bP01029 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
C4bP01029 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
C4bP01029 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
C4bP01029 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
C4bP01029 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
C4bP01029 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
C4bP01029 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
C4bP01029 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
C4bP01029 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
C4bP01029 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
C4bP01029 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
C4bP01029 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
C4bP01029 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
C4bP01029 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
C4bP01029 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
C4bP01029 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
C4bP01029 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
C4bP01029 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
C4bP01029 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
C4bP01029 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
C4bP01029 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
C4bP01029 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
C4bP01029 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
C4bP01029 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
C4bP01029 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
C4bP01029 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
C4bP01029 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
C4bP01029 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
C4bP01029 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
C4bP01029 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
C4bP01029 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
C4bP01029 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
C4bP01029 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
C4bP01029 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
C4bP01029 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
C4bP01029 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
C4bP01029 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
C4bP01029 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
C4bP01029 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
C4bP01029 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
C4bP01029 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
C4bP01029 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
C4bP01029 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
C4bP01029 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
C4bP01029 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
C4bP01029 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
C4bP01029 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
C4bP01029 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
C4bP01029 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
C4bP01029 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
C4bP01029 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
C4bP01029 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
C4bP01029 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
C4bP01029 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
C4bP01029 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
C4bP01029 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
C4bP01029 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
C4bP01029 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
C4bP01029 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
C4bP01029 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
C4bP01029 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
C4bP01029 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
C4bP01029 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
C4bP01029 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
C4bP01029 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
C4bP01029 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
C4bP01029 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
C4bP01029 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
C4bP01029 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
C4bP01029 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
C4bP01029 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
C4bP01029 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
C4bP01029 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
C4bP01029 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
C4bP01029 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
C4bP01029 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
C4bP01029 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
C4bP01029 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
C4bP01029 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
C4bP01029 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
C4bP01029 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
C4bP01029 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
C4bP01029 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
C4bP01029 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
C4bP01029 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
C4bP01029 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
C4bP01029 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
C4bP01029 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms