Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Parp2O88554 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Parp2O88554 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Parp2O88554 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Parp2O88554 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Parp2O88554 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Parp2O88554 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Parp2O88554 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Parp2O88554 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,27■■■□□ 2,44
Parp2O88554 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Parp2O88554 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Parp2O88554 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Parp2O88554 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Parp2O88554 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Parp2O88554 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Parp2O88554 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
Parp2O88554 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Parp2O88554 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Parp2O88554 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Parp2O88554 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Parp2O88554 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Parp2O88554 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Parp2O88554 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Parp2O88554 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Parp2O88554 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Parp2O88554 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Parp2O88554 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Parp2O88554 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Parp2O88554 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Parp2O88554 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Parp2O88554 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Parp2O88554 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Parp2O88554 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Parp2O88554 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Parp2O88554 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Parp2O88554 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Parp2O88554 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30■■■□□ 2,39
Parp2O88554 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Parp2O88554 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Parp2O88554 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Parp2O88554 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Parp2O88554 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Parp2O88554 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Parp2O88554 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Parp2O88554 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Parp2O88554 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Parp2O88554 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Parp2O88554 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Parp2O88554 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Parp2O88554 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Parp2O88554 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Parp2O88554 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Parp2O88554 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Parp2O88554 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Parp2O88554 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Parp2O88554 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Parp2O88554 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Parp2O88554 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Parp2O88554 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Parp2O88554 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Parp2O88554 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Parp2O88554 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Parp2O88554 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Parp2O88554 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Parp2O88554 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Parp2O88554 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,7■■■□□ 2,34
Parp2O88554 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Parp2O88554 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Parp2O88554 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Parp2O88554 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Parp2O88554 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Parp2O88554 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Parp2O88554 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Parp2O88554 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Parp2O88554 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Parp2O88554 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Parp2O88554 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Parp2O88554 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Parp2O88554 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Parp2O88554 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Parp2O88554 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Parp2O88554 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Parp2O88554 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Parp2O88554 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Parp2O88554 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Parp2O88554 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Parp2O88554 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Parp2O88554 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Parp2O88554 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Parp2O88554 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Parp2O88554 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
Parp2O88554 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Parp2O88554 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Parp2O88554 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Parp2O88554 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Parp2O88554 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Parp2O88554 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Parp2O88554 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Parp2O88554 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Parp2O88554 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,2 ms