Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,93■■■■□ 3,34
Nid2O88322 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Nid2O88322 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Nid2O88322 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Nid2O88322 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Nid2O88322 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC35,83■■■■□ 3,33
Nid2O88322 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC35,8■■■■□ 3,32
Nid2O88322 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Nid2O88322 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Nid2O88322 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Nid2O88322 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Nid2O88322 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC35,72■■■■□ 3,31
Nid2O88322 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,3
Nid2O88322 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Nid2O88322 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35,67■■■■□ 3,3
Nid2O88322 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC35,66■■■■□ 3,3
Nid2O88322 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC35,65■■■■□ 3,3
Nid2O88322 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Nid2O88322 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,6■■■■□ 3,29
Nid2O88322 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,59■■■■□ 3,29
Nid2O88322 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC35,57■■■■□ 3,29
Nid2O88322 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,29
Nid2O88322 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Nid2O88322 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
Nid2O88322 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35,52■■■■□ 3,28
Nid2O88322 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Nid2O88322 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35,5■■■■□ 3,27
Nid2O88322 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,5■■■■□ 3,27
Nid2O88322 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Nid2O88322 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Nid2O88322 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Nid2O88322 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Nid2O88322 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Nid2O88322 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35,46■■■■□ 3,27
Nid2O88322 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Nid2O88322 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Nid2O88322 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Nid2O88322 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Nid2O88322 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Nid2O88322 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Nid2O88322 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,35■■■■□ 3,25
Nid2O88322 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Nid2O88322 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,34■■■■□ 3,25
Nid2O88322 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Nid2O88322 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,25
Nid2O88322 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC35,32■■■■□ 3,24
Nid2O88322 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35,31■■■■□ 3,24
Nid2O88322 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Nid2O88322 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,31■■■■□ 3,24
Nid2O88322 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC35,3■■■■□ 3,24
Nid2O88322 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Nid2O88322 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35,26■■■■□ 3,24
Nid2O88322 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
Nid2O88322 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC35,22■■■■□ 3,23
Nid2O88322 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Nid2O88322 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC35,21■■■■□ 3,23
Nid2O88322 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Nid2O88322 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Nid2O88322 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Nid2O88322 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35,11■■■■□ 3,21
Nid2O88322 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35,11■■■■□ 3,21
Nid2O88322 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Nid2O88322 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Nid2O88322 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Nid2O88322 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35,05■■■■□ 3,2
Nid2O88322 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35,03■■■■□ 3,2
Nid2O88322 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35,03■■■■□ 3,2
Nid2O88322 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Nid2O88322 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,19
Nid2O88322 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34,99■■■■□ 3,19
Nid2O88322 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34,99■■■■□ 3,19
Nid2O88322 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Nid2O88322 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC34,98■■■■□ 3,19
Nid2O88322 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
Nid2O88322 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC34,95■■■■□ 3,19
Nid2O88322 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Nid2O88322 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Nid2O88322 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC34,9■■■■□ 3,18
Nid2O88322 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC34,89■■■■□ 3,18
Nid2O88322 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Nid2O88322 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34,88■■■■□ 3,17
Nid2O88322 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Nid2O88322 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Nid2O88322 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Nid2O88322 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,8■■■■□ 3,16
Nid2O88322 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Nid2O88322 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Nid2O88322 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34,74■■■■□ 3,15
Nid2O88322 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34,72■■■■□ 3,15
Nid2O88322 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Nid2O88322 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34,72■■■■□ 3,15
Nid2O88322 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Nid2O88322 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34,7■■■■□ 3,15
Nid2O88322 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,14
Nid2O88322 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34,68■■■■□ 3,14
Nid2O88322 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Nid2O88322 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Nid2O88322 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Nid2O88322 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Nid2O88322 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms