Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ChadO55226 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ChadO55226 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ChadO55226 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ChadO55226 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ChadO55226 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ChadO55226 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ChadO55226 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ChadO55226 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ChadO55226 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ChadO55226 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ChadO55226 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ChadO55226 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ChadO55226 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ChadO55226 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ChadO55226 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ChadO55226 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ChadO55226 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ChadO55226 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ChadO55226 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ChadO55226 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ChadO55226 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ChadO55226 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ChadO55226 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ChadO55226 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ChadO55226 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ChadO55226 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ChadO55226 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ChadO55226 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ChadO55226 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ChadO55226 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ChadO55226 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ChadO55226 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ChadO55226 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ChadO55226 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ChadO55226 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ChadO55226 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ChadO55226 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ChadO55226 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ChadO55226 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ChadO55226 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ChadO55226 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ChadO55226 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ChadO55226 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ChadO55226 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ChadO55226 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ChadO55226 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ChadO55226 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ChadO55226 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ChadO55226 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ChadO55226 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ChadO55226 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ChadO55226 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ChadO55226 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ChadO55226 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ChadO55226 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ChadO55226 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ChadO55226 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ChadO55226 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ChadO55226 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ChadO55226 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ChadO55226 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ChadO55226 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ChadO55226 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ChadO55226 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ChadO55226 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ChadO55226 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ChadO55226 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ChadO55226 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ChadO55226 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ChadO55226 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ChadO55226 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ChadO55226 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ChadO55226 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ChadO55226 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ChadO55226 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ChadO55226 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ChadO55226 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ChadO55226 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ChadO55226 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ChadO55226 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ChadO55226 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ChadO55226 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ChadO55226 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ChadO55226 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ChadO55226 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ChadO55226 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ChadO55226 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ChadO55226 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ChadO55226 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ChadO55226 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChadO55226 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ChadO55226 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ChadO55226 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ChadO55226 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ChadO55226 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ChadO55226 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ChadO55226 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ChadO55226 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ChadO55226 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms