Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SlkO54988 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SlkO54988 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SlkO54988 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SlkO54988 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SlkO54988 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SlkO54988 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SlkO54988 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SlkO54988 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SlkO54988 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SlkO54988 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SlkO54988 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SlkO54988 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SlkO54988 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SlkO54988 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SlkO54988 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SlkO54988 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SlkO54988 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SlkO54988 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SlkO54988 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SlkO54988 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SlkO54988 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SlkO54988 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SlkO54988 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SlkO54988 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SlkO54988 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SlkO54988 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SlkO54988 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SlkO54988 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SlkO54988 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SlkO54988 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SlkO54988 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SlkO54988 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SlkO54988 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SlkO54988 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SlkO54988 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SlkO54988 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SlkO54988 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SlkO54988 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SlkO54988 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SlkO54988 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SlkO54988 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SlkO54988 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SlkO54988 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SlkO54988 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SlkO54988 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SlkO54988 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SlkO54988 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SlkO54988 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SlkO54988 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SlkO54988 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SlkO54988 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SlkO54988 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SlkO54988 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SlkO54988 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SlkO54988 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SlkO54988 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SlkO54988 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SlkO54988 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SlkO54988 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SlkO54988 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SlkO54988 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SlkO54988 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SlkO54988 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SlkO54988 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SlkO54988 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SlkO54988 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SlkO54988 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SlkO54988 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SlkO54988 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SlkO54988 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SlkO54988 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SlkO54988 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SlkO54988 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SlkO54988 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SlkO54988 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SlkO54988 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SlkO54988 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SlkO54988 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SlkO54988 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SlkO54988 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SlkO54988 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SlkO54988 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SlkO54988 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SlkO54988 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SlkO54988 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SlkO54988 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SlkO54988 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SlkO54988 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SlkO54988 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SlkO54988 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SlkO54988 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SlkO54988 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SlkO54988 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SlkO54988 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SlkO54988 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SlkO54988 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SlkO54988 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SlkO54988 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SlkO54988 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms