Protein–RNA interactions for Protein: O54839

Eomes, Eomesodermin homolog, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EomesO54839 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
EomesO54839 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,12
EomesO54839 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28,23■■■□□ 2,11
EomesO54839 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
EomesO54839 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
EomesO54839 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
EomesO54839 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
EomesO54839 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
EomesO54839 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
EomesO54839 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
EomesO54839 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
EomesO54839 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
EomesO54839 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
EomesO54839 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
EomesO54839 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,13■■■□□ 2,09
EomesO54839 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
EomesO54839 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28,11■■■□□ 2,09
EomesO54839 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,1■■■□□ 2,09
EomesO54839 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
EomesO54839 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
EomesO54839 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
EomesO54839 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,08
EomesO54839 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28,07■■■□□ 2,08
EomesO54839 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
EomesO54839 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
EomesO54839 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28,06■■■□□ 2,08
EomesO54839 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28,05■■■□□ 2,08
EomesO54839 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
EomesO54839 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28,03■■■□□ 2,08
EomesO54839 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
EomesO54839 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
EomesO54839 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
EomesO54839 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
EomesO54839 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
EomesO54839 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
EomesO54839 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
EomesO54839 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
EomesO54839 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
EomesO54839 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
EomesO54839 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
EomesO54839 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
EomesO54839 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
EomesO54839 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
EomesO54839 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,82■■■□□ 2,04
EomesO54839 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
EomesO54839 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
EomesO54839 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27,77■■■□□ 2,04
EomesO54839 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
EomesO54839 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27,76■■■□□ 2,03
EomesO54839 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27,75■■■□□ 2,03
EomesO54839 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,75■■■□□ 2,03
EomesO54839 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
EomesO54839 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
EomesO54839 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
EomesO54839 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
EomesO54839 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27,7■■■□□ 2,02
EomesO54839 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
EomesO54839 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27,67■■■□□ 2,02
EomesO54839 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
EomesO54839 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
EomesO54839 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
EomesO54839 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
EomesO54839 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
EomesO54839 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
EomesO54839 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27,55■■■□□ 2
EomesO54839 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
EomesO54839 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
EomesO54839 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,52■■■□□ 2
EomesO54839 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
EomesO54839 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
EomesO54839 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
EomesO54839 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
EomesO54839 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
EomesO54839 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
EomesO54839 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
EomesO54839 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
EomesO54839 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
EomesO54839 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
EomesO54839 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
EomesO54839 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
EomesO54839 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
EomesO54839 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
EomesO54839 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
EomesO54839 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
EomesO54839 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
EomesO54839 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
EomesO54839 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
EomesO54839 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
EomesO54839 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
EomesO54839 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
EomesO54839 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
EomesO54839 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
EomesO54839 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
EomesO54839 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
EomesO54839 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
EomesO54839 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
EomesO54839 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
EomesO54839 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,14■■□□□ 1,94
EomesO54839 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
EomesO54839 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,5 ms