Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Bnc1O35914 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Bnc1O35914 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Bnc1O35914 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Bnc1O35914 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Bnc1O35914 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Bnc1O35914 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Bnc1O35914 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Bnc1O35914 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Bnc1O35914 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Bnc1O35914 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Bnc1O35914 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Bnc1O35914 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Bnc1O35914 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Bnc1O35914 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Bnc1O35914 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Bnc1O35914 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Bnc1O35914 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Bnc1O35914 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26,38■■□□□ 1,81
Bnc1O35914 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Bnc1O35914 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Bnc1O35914 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Bnc1O35914 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Bnc1O35914 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Bnc1O35914 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Bnc1O35914 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Bnc1O35914 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Bnc1O35914 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,24■■□□□ 1,79
Bnc1O35914 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Bnc1O35914 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Bnc1O35914 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Bnc1O35914 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Bnc1O35914 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26,19■■□□□ 1,78
Bnc1O35914 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Bnc1O35914 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Bnc1O35914 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Bnc1O35914 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Bnc1O35914 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,16■■□□□ 1,78
Bnc1O35914 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Bnc1O35914 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Bnc1O35914 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Bnc1O35914 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Bnc1O35914 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Bnc1O35914 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Bnc1O35914 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Bnc1O35914 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Bnc1O35914 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Bnc1O35914 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Bnc1O35914 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Bnc1O35914 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Bnc1O35914 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Bnc1O35914 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26,03■■□□□ 1,76
Bnc1O35914 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Bnc1O35914 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Bnc1O35914 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Bnc1O35914 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Bnc1O35914 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Bnc1O35914 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Bnc1O35914 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Bnc1O35914 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Bnc1O35914 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Bnc1O35914 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Bnc1O35914 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Bnc1O35914 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Bnc1O35914 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Bnc1O35914 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Bnc1O35914 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Bnc1O35914 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Bnc1O35914 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Bnc1O35914 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,89■■□□□ 1,74
Bnc1O35914 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Bnc1O35914 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Bnc1O35914 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Bnc1O35914 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Bnc1O35914 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Bnc1O35914 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Bnc1O35914 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Bnc1O35914 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Bnc1O35914 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Bnc1O35914 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Bnc1O35914 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Bnc1O35914 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Bnc1O35914 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Bnc1O35914 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Bnc1O35914 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Bnc1O35914 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Bnc1O35914 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
Bnc1O35914 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Bnc1O35914 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Bnc1O35914 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Bnc1O35914 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Bnc1O35914 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Bnc1O35914 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
Bnc1O35914 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Bnc1O35914 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Bnc1O35914 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Bnc1O35914 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Bnc1O35914 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Bnc1O35914 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Bnc1O35914 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms