Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CckarO08786 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CckarO08786 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CckarO08786 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CckarO08786 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CckarO08786 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CckarO08786 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CckarO08786 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CckarO08786 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CckarO08786 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CckarO08786 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CckarO08786 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CckarO08786 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CckarO08786 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CckarO08786 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CckarO08786 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CckarO08786 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CckarO08786 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CckarO08786 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CckarO08786 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CckarO08786 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CckarO08786 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CckarO08786 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CckarO08786 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CckarO08786 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CckarO08786 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CckarO08786 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CckarO08786 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CckarO08786 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CckarO08786 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CckarO08786 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CckarO08786 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CckarO08786 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CckarO08786 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CckarO08786 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CckarO08786 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CckarO08786 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CckarO08786 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CckarO08786 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CckarO08786 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CckarO08786 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CckarO08786 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CckarO08786 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CckarO08786 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CckarO08786 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CckarO08786 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CckarO08786 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CckarO08786 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CckarO08786 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CckarO08786 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CckarO08786 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CckarO08786 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CckarO08786 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CckarO08786 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CckarO08786 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CckarO08786 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CckarO08786 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CckarO08786 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CckarO08786 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CckarO08786 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CckarO08786 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CckarO08786 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CckarO08786 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CckarO08786 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CckarO08786 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CckarO08786 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CckarO08786 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CckarO08786 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CckarO08786 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CckarO08786 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CckarO08786 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CckarO08786 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CckarO08786 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CckarO08786 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CckarO08786 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CckarO08786 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CckarO08786 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CckarO08786 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CckarO08786 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CckarO08786 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CckarO08786 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CckarO08786 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CckarO08786 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CckarO08786 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CckarO08786 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CckarO08786 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CckarO08786 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CckarO08786 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CckarO08786 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CckarO08786 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CckarO08786 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CckarO08786 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CckarO08786 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CckarO08786 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CckarO08786 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CckarO08786 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CckarO08786 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CckarO08786 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CckarO08786 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CckarO08786 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms