Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mesp2O08574 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mesp2O08574 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mesp2O08574 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mesp2O08574 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mesp2O08574 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mesp2O08574 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mesp2O08574 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mesp2O08574 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mesp2O08574 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mesp2O08574 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mesp2O08574 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mesp2O08574 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mesp2O08574 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mesp2O08574 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mesp2O08574 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mesp2O08574 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mesp2O08574 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mesp2O08574 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mesp2O08574 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mesp2O08574 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mesp2O08574 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mesp2O08574 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mesp2O08574 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mesp2O08574 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mesp2O08574 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mesp2O08574 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mesp2O08574 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mesp2O08574 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mesp2O08574 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mesp2O08574 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mesp2O08574 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mesp2O08574 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mesp2O08574 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mesp2O08574 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mesp2O08574 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mesp2O08574 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mesp2O08574 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mesp2O08574 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mesp2O08574 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Mesp2O08574 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mesp2O08574 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mesp2O08574 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mesp2O08574 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mesp2O08574 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mesp2O08574 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mesp2O08574 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mesp2O08574 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mesp2O08574 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mesp2O08574 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mesp2O08574 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Mesp2O08574 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mesp2O08574 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mesp2O08574 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mesp2O08574 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mesp2O08574 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mesp2O08574 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mesp2O08574 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mesp2O08574 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mesp2O08574 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mesp2O08574 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mesp2O08574 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mesp2O08574 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mesp2O08574 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mesp2O08574 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mesp2O08574 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Mesp2O08574 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mesp2O08574 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mesp2O08574 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mesp2O08574 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mesp2O08574 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mesp2O08574 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mesp2O08574 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mesp2O08574 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mesp2O08574 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mesp2O08574 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mesp2O08574 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mesp2O08574 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mesp2O08574 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mesp2O08574 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mesp2O08574 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mesp2O08574 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mesp2O08574 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mesp2O08574 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mesp2O08574 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mesp2O08574 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mesp2O08574 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mesp2O08574 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mesp2O08574 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mesp2O08574 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mesp2O08574 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mesp2O08574 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mesp2O08574 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mesp2O08574 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mesp2O08574 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mesp2O08574 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mesp2O08574 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mesp2O08574 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mesp2O08574 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mesp2O08574 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms