Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5849J3QPE5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5849J3QPE5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5849J3QPE5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5849J3QPE5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5849J3QPE5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5849J3QPE5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5849J3QPE5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5849J3QPE5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5849J3QPE5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5849J3QPE5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5849J3QPE5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5849J3QPE5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5849J3QPE5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5849J3QPE5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5849J3QPE5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5849J3QPE5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5849J3QPE5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5849J3QPE5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5849J3QPE5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5849J3QPE5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5849J3QPE5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5849J3QPE5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5849J3QPE5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5849J3QPE5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5849J3QPE5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5849J3QPE5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5849J3QPE5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5849J3QPE5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5849J3QPE5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5849J3QPE5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5849J3QPE5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5849J3QPE5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5849J3QPE5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5849J3QPE5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5849J3QPE5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5849J3QPE5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5849J3QPE5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm5849J3QPE5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5849J3QPE5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5849J3QPE5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5849J3QPE5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5849J3QPE5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5849J3QPE5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5849J3QPE5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm5849J3QPE5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm5849J3QPE5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm5849J3QPE5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5849J3QPE5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5849J3QPE5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5849J3QPE5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5849J3QPE5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5849J3QPE5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5849J3QPE5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5849J3QPE5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5849J3QPE5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5849J3QPE5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5849J3QPE5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5849J3QPE5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5849J3QPE5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5849J3QPE5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5849J3QPE5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5849J3QPE5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5849J3QPE5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5849J3QPE5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5849J3QPE5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5849J3QPE5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5849J3QPE5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5849J3QPE5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5849J3QPE5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5849J3QPE5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5849J3QPE5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5849J3QPE5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5849J3QPE5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5849J3QPE5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5849J3QPE5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5849J3QPE5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5849J3QPE5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5849J3QPE5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm5849J3QPE5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm5849J3QPE5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5849J3QPE5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5849J3QPE5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5849J3QPE5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5849J3QPE5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5849J3QPE5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5849J3QPE5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5849J3QPE5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5849J3QPE5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5849J3QPE5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5849J3QPE5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5849J3QPE5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5849J3QPE5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5849J3QPE5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5849J3QPE5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5849J3QPE5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5849J3QPE5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5849J3QPE5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm5849J3QPE5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm5849J3QPE5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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