Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc179J3QM76 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc179J3QM76 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc179J3QM76 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc179J3QM76 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc179J3QM76 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc179J3QM76 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc179J3QM76 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc179J3QM76 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc179J3QM76 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc179J3QM76 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc179J3QM76 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc179J3QM76 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc179J3QM76 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc179J3QM76 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc179J3QM76 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc179J3QM76 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc179J3QM76 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc179J3QM76 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc179J3QM76 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc179J3QM76 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc179J3QM76 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc179J3QM76 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc179J3QM76 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc179J3QM76 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc179J3QM76 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc179J3QM76 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc179J3QM76 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc179J3QM76 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc179J3QM76 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc179J3QM76 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc179J3QM76 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc179J3QM76 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc179J3QM76 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc179J3QM76 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc179J3QM76 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc179J3QM76 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc179J3QM76 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc179J3QM76 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc179J3QM76 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc179J3QM76 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc179J3QM76 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc179J3QM76 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc179J3QM76 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc179J3QM76 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc179J3QM76 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc179J3QM76 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc179J3QM76 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc179J3QM76 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc179J3QM76 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc179J3QM76 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc179J3QM76 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc179J3QM76 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc179J3QM76 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc179J3QM76 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc179J3QM76 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc179J3QM76 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc179J3QM76 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc179J3QM76 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc179J3QM76 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc179J3QM76 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc179J3QM76 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc179J3QM76 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc179J3QM76 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc179J3QM76 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc179J3QM76 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc179J3QM76 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc179J3QM76 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc179J3QM76 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc179J3QM76 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc179J3QM76 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc179J3QM76 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc179J3QM76 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc179J3QM76 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc179J3QM76 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc179J3QM76 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc179J3QM76 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc179J3QM76 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc179J3QM76 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc179J3QM76 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc179J3QM76 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc179J3QM76 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc179J3QM76 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc179J3QM76 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc179J3QM76 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc179J3QM76 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc179J3QM76 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc179J3QM76 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc179J3QM76 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc179J3QM76 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc179J3QM76 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc179J3QM76 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc179J3QM76 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc179J3QM76 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc179J3QM76 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc179J3QM76 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc179J3QM76 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc179J3QM76 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc179J3QM76 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc179J3QM76 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms