Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Arfgef1G3X9K3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Arfgef1G3X9K3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Arfgef1G3X9K3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Arfgef1G3X9K3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Arfgef1G3X9K3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Arfgef1G3X9K3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Arfgef1G3X9K3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Arfgef1G3X9K3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Arfgef1G3X9K3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Arfgef1G3X9K3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Arfgef1G3X9K3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Arfgef1G3X9K3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Arfgef1G3X9K3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Arfgef1G3X9K3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Arfgef1G3X9K3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Arfgef1G3X9K3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Arfgef1G3X9K3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Arfgef1G3X9K3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Arfgef1G3X9K3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Arfgef1G3X9K3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Arfgef1G3X9K3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Arfgef1G3X9K3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Arfgef1G3X9K3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Arfgef1G3X9K3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Arfgef1G3X9K3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Arfgef1G3X9K3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Arfgef1G3X9K3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Arfgef1G3X9K3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Arfgef1G3X9K3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Arfgef1G3X9K3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Arfgef1G3X9K3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Arfgef1G3X9K3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Arfgef1G3X9K3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Arfgef1G3X9K3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Arfgef1G3X9K3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Arfgef1G3X9K3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Arfgef1G3X9K3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Arfgef1G3X9K3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Arfgef1G3X9K3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Arfgef1G3X9K3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
Arfgef1G3X9K3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Arfgef1G3X9K3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Arfgef1G3X9K3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Arfgef1G3X9K3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Arfgef1G3X9K3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Arfgef1G3X9K3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Arfgef1G3X9K3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Arfgef1G3X9K3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Arfgef1G3X9K3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Arfgef1G3X9K3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Arfgef1G3X9K3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Arfgef1G3X9K3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Arfgef1G3X9K3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Arfgef1G3X9K3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Arfgef1G3X9K3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Arfgef1G3X9K3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Arfgef1G3X9K3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Arfgef1G3X9K3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Arfgef1G3X9K3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Arfgef1G3X9K3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Arfgef1G3X9K3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Arfgef1G3X9K3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Arfgef1G3X9K3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Arfgef1G3X9K3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Arfgef1G3X9K3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Arfgef1G3X9K3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Arfgef1G3X9K3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Arfgef1G3X9K3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Arfgef1G3X9K3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Arfgef1G3X9K3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Arfgef1G3X9K3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Arfgef1G3X9K3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Arfgef1G3X9K3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Arfgef1G3X9K3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Arfgef1G3X9K3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Arfgef1G3X9K3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Arfgef1G3X9K3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Arfgef1G3X9K3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Arfgef1G3X9K3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Arfgef1G3X9K3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Arfgef1G3X9K3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Arfgef1G3X9K3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Arfgef1G3X9K3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Arfgef1G3X9K3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Arfgef1G3X9K3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Arfgef1G3X9K3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Arfgef1G3X9K3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Arfgef1G3X9K3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Arfgef1G3X9K3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Arfgef1G3X9K3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Arfgef1G3X9K3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Arfgef1G3X9K3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Arfgef1G3X9K3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Arfgef1G3X9K3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Arfgef1G3X9K3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Arfgef1G3X9K3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Arfgef1G3X9K3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Arfgef1G3X9K3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Arfgef1G3X9K3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms