Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim55G3X8Y1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Trim55G3X8Y1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim55G3X8Y1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim55G3X8Y1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim55G3X8Y1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim55G3X8Y1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim55G3X8Y1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim55G3X8Y1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim55G3X8Y1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim55G3X8Y1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim55G3X8Y1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim55G3X8Y1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim55G3X8Y1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim55G3X8Y1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim55G3X8Y1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim55G3X8Y1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim55G3X8Y1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim55G3X8Y1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim55G3X8Y1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim55G3X8Y1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim55G3X8Y1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim55G3X8Y1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim55G3X8Y1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim55G3X8Y1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim55G3X8Y1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim55G3X8Y1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim55G3X8Y1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim55G3X8Y1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim55G3X8Y1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim55G3X8Y1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim55G3X8Y1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Trim55G3X8Y1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim55G3X8Y1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim55G3X8Y1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim55G3X8Y1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim55G3X8Y1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim55G3X8Y1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim55G3X8Y1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim55G3X8Y1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim55G3X8Y1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim55G3X8Y1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim55G3X8Y1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim55G3X8Y1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trim55G3X8Y1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim55G3X8Y1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim55G3X8Y1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim55G3X8Y1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim55G3X8Y1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim55G3X8Y1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim55G3X8Y1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim55G3X8Y1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim55G3X8Y1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim55G3X8Y1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim55G3X8Y1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim55G3X8Y1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim55G3X8Y1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim55G3X8Y1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim55G3X8Y1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim55G3X8Y1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim55G3X8Y1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim55G3X8Y1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim55G3X8Y1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim55G3X8Y1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim55G3X8Y1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim55G3X8Y1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim55G3X8Y1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim55G3X8Y1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim55G3X8Y1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim55G3X8Y1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim55G3X8Y1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim55G3X8Y1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim55G3X8Y1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim55G3X8Y1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim55G3X8Y1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim55G3X8Y1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim55G3X8Y1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim55G3X8Y1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim55G3X8Y1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim55G3X8Y1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim55G3X8Y1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim55G3X8Y1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim55G3X8Y1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim55G3X8Y1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim55G3X8Y1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim55G3X8Y1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim55G3X8Y1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim55G3X8Y1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim55G3X8Y1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim55G3X8Y1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim55G3X8Y1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim55G3X8Y1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim55G3X8Y1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim55G3X8Y1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim55G3X8Y1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim55G3X8Y1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim55G3X8Y1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim55G3X8Y1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim55G3X8Y1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim55G3X8Y1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms