Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17455G3UW87 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17455G3UW87 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17455G3UW87 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17455G3UW87 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17455G3UW87 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17455G3UW87 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm17455G3UW87 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm17455G3UW87 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm17455G3UW87 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm17455G3UW87 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm17455G3UW87 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm17455G3UW87 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm17455G3UW87 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm17455G3UW87 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm17455G3UW87 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm17455G3UW87 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm17455G3UW87 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm17455G3UW87 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm17455G3UW87 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm17455G3UW87 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm17455G3UW87 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm17455G3UW87 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm17455G3UW87 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm17455G3UW87 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm17455G3UW87 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm17455G3UW87 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm17455G3UW87 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm17455G3UW87 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm17455G3UW87 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm17455G3UW87 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm17455G3UW87 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17455G3UW87 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm17455G3UW87 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm17455G3UW87 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17455G3UW87 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17455G3UW87 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm17455G3UW87 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17455G3UW87 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17455G3UW87 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm17455G3UW87 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm17455G3UW87 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17455G3UW87 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17455G3UW87 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm17455G3UW87 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm17455G3UW87 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm17455G3UW87 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm17455G3UW87 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm17455G3UW87 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm17455G3UW87 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm17455G3UW87 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm17455G3UW87 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm17455G3UW87 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm17455G3UW87 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm17455G3UW87 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm17455G3UW87 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm17455G3UW87 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm17455G3UW87 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm17455G3UW87 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm17455G3UW87 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm17455G3UW87 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm17455G3UW87 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm17455G3UW87 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm17455G3UW87 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm17455G3UW87 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm17455G3UW87 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm17455G3UW87 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm17455G3UW87 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm17455G3UW87 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm17455G3UW87 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm17455G3UW87 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm17455G3UW87 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm17455G3UW87 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm17455G3UW87 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm17455G3UW87 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm17455G3UW87 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm17455G3UW87 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm17455G3UW87 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm17455G3UW87 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm17455G3UW87 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm17455G3UW87 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm17455G3UW87 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm17455G3UW87 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm17455G3UW87 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm17455G3UW87 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm17455G3UW87 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm17455G3UW87 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm17455G3UW87 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm17455G3UW87 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm17455G3UW87 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm17455G3UW87 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm17455G3UW87 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm17455G3UW87 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm17455G3UW87 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm17455G3UW87 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm17455G3UW87 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm17455G3UW87 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm17455G3UW87 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm17455G3UW87 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm17455G3UW87 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm17455G3UW87 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms