Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN4

Agl, Amylo-1,6-glucosidase, 4-alpha-glucanotransferase, mousemouse

Predictions only

Length 1,532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AglF8VPN4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,2■■■■■ 4,19
AglF8VPN4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC41,2■■■■■ 4,19
AglF8VPN4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,2■■■■■ 4,19
AglF8VPN4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC41,19■■■■■ 4,18
AglF8VPN4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC41,17■■■■■ 4,18
AglF8VPN4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,17■■■■■ 4,18
AglF8VPN4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41,16■■■■■ 4,18
AglF8VPN4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,11■■■■■ 4,17
AglF8VPN4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC41,11■■■■■ 4,17
AglF8VPN4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,09■■■■■ 4,17
AglF8VPN4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,09■■■■■ 4,17
AglF8VPN4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,06■■■■■ 4,16
AglF8VPN4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,05■■■■■ 4,16
AglF8VPN4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,03■■■■■ 4,16
AglF8VPN4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC40,99■■■■■ 4,15
AglF8VPN4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC40,98■■■■■ 4,15
AglF8VPN4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
AglF8VPN4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,93■■■■■ 4,14
AglF8VPN4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40,93■■■■■ 4,14
AglF8VPN4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
AglF8VPN4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
AglF8VPN4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
AglF8VPN4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,88■■■■■ 4,13
AglF8VPN4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,88■■■■■ 4,13
AglF8VPN4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40,87■■■■■ 4,13
AglF8VPN4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,87■■■■■ 4,13
AglF8VPN4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC40,85■■■■■ 4,13
AglF8VPN4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,85■■■■■ 4,13
AglF8VPN4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC40,83■■■■■ 4,13
AglF8VPN4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,82■■■■■ 4,12
AglF8VPN4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC40,8■■■■■ 4,12
AglF8VPN4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,8■■■■■ 4,12
AglF8VPN4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC40,79■■■■■ 4,12
AglF8VPN4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC40,78■■■■■ 4,12
AglF8VPN4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC40,77■■■■■ 4,12
AglF8VPN4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC40,75■■■■■ 4,11
AglF8VPN4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC40,74■■■■■ 4,11
AglF8VPN4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,73■■■■■ 4,11
AglF8VPN4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC40,71■■■■■ 4,11
AglF8VPN4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
AglF8VPN4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,69■■■■■ 4,1
AglF8VPN4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC40,68■■■■■ 4,1
AglF8VPN4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC40,63■■■■■ 4,09
AglF8VPN4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC40,63■■■■■ 4,09
AglF8VPN4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC40,59■■■■■ 4,09
AglF8VPN4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
AglF8VPN4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
AglF8VPN4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,53■■■■■ 4,08
AglF8VPN4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC40,49■■■■■ 4,07
AglF8VPN4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC40,48■■■■■ 4,07
AglF8VPN4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
AglF8VPN4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC40,45■■■■■ 4,07
AglF8VPN4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC40,43■■■■■ 4,06
AglF8VPN4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC40,42■■■■■ 4,06
AglF8VPN4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC40,42■■■■■ 4,06
AglF8VPN4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,4■■■■■ 4,06
AglF8VPN4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC40,37■■■■■ 4,05
AglF8VPN4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,36■■■■■ 4,05
AglF8VPN4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC40,35■■■■■ 4,05
AglF8VPN4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
AglF8VPN4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC40,29■■■■■ 4,04
AglF8VPN4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC40,27■■■■■ 4,04
AglF8VPN4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC40,27■■■■■ 4,04
AglF8VPN4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC40,25■■■■■ 4,03
AglF8VPN4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,25■■■■■ 4,03
AglF8VPN4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC40,25■■■■■ 4,03
AglF8VPN4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,23■■■■■ 4,03
AglF8VPN4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,21■■■■■ 4,03
AglF8VPN4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,21■■■■■ 4,03
AglF8VPN4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
AglF8VPN4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,16■■■■■ 4,02
AglF8VPN4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,13■■■■■ 4,02
AglF8VPN4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,08■■■■■ 4,01
AglF8VPN4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,07■■■■■ 4,01
AglF8VPN4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC40,03■■■■■ 4
AglF8VPN4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,97■■■■□ 3,99
AglF8VPN4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39,96■■■■□ 3,99
AglF8VPN4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC39,95■■■■□ 3,99
AglF8VPN4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,92■■■■□ 3,98
AglF8VPN4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC39,91■■■■□ 3,98
AglF8VPN4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,91■■■■□ 3,98
AglF8VPN4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,89■■■■□ 3,98
AglF8VPN4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC39,84■■■■□ 3,97
AglF8VPN4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,82■■■■□ 3,97
AglF8VPN4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC39,81■■■■□ 3,96
AglF8VPN4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC39,76■■■■□ 3,96
AglF8VPN4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC39,75■■■■□ 3,95
AglF8VPN4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,73■■■■□ 3,95
AglF8VPN4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,7■■■■□ 3,95
AglF8VPN4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC39,69■■■■□ 3,94
AglF8VPN4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,68■■■■□ 3,94
AglF8VPN4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC39,68■■■■□ 3,94
AglF8VPN4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,67■■■■□ 3,94
AglF8VPN4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC39,67■■■■□ 3,94
AglF8VPN4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,66■■■■□ 3,94
AglF8VPN4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC39,65■■■■□ 3,94
AglF8VPN4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC39,64■■■■□ 3,94
AglF8VPN4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,63■■■■□ 3,93
AglF8VPN4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC39,6■■■■□ 3,93
AglF8VPN4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC39,56■■■■□ 3,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms