Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8005F6YKY3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8005F6YKY3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8005F6YKY3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8005F6YKY3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8005F6YKY3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8005F6YKY3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8005F6YKY3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8005F6YKY3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8005F6YKY3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8005F6YKY3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8005F6YKY3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8005F6YKY3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8005F6YKY3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8005F6YKY3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8005F6YKY3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8005F6YKY3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8005F6YKY3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm8005F6YKY3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm8005F6YKY3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8005F6YKY3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8005F6YKY3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8005F6YKY3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8005F6YKY3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8005F6YKY3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8005F6YKY3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8005F6YKY3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8005F6YKY3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8005F6YKY3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8005F6YKY3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8005F6YKY3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8005F6YKY3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8005F6YKY3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8005F6YKY3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8005F6YKY3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm8005F6YKY3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8005F6YKY3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8005F6YKY3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8005F6YKY3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8005F6YKY3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8005F6YKY3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8005F6YKY3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8005F6YKY3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8005F6YKY3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8005F6YKY3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8005F6YKY3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8005F6YKY3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8005F6YKY3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8005F6YKY3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8005F6YKY3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8005F6YKY3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8005F6YKY3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8005F6YKY3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8005F6YKY3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8005F6YKY3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8005F6YKY3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8005F6YKY3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm8005F6YKY3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8005F6YKY3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8005F6YKY3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8005F6YKY3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8005F6YKY3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8005F6YKY3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8005F6YKY3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8005F6YKY3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8005F6YKY3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8005F6YKY3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8005F6YKY3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8005F6YKY3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8005F6YKY3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8005F6YKY3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8005F6YKY3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8005F6YKY3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8005F6YKY3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8005F6YKY3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8005F6YKY3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8005F6YKY3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8005F6YKY3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8005F6YKY3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8005F6YKY3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8005F6YKY3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8005F6YKY3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8005F6YKY3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8005F6YKY3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8005F6YKY3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8005F6YKY3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8005F6YKY3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8005F6YKY3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8005F6YKY3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm8005F6YKY3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm8005F6YKY3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm8005F6YKY3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm8005F6YKY3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8005F6YKY3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8005F6YKY3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8005F6YKY3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8005F6YKY3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8005F6YKY3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8005F6YKY3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8005F6YKY3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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