Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933403O08RikF6UK53 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933403O08RikF6UK53 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933403O08RikF6UK53 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933403O08RikF6UK53 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933403O08RikF6UK53 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933403O08RikF6UK53 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933403O08RikF6UK53 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933403O08RikF6UK53 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933403O08RikF6UK53 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
4933403O08RikF6UK53 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933403O08RikF6UK53 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933403O08RikF6UK53 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933403O08RikF6UK53 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
4933403O08RikF6UK53 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933403O08RikF6UK53 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933403O08RikF6UK53 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
4933403O08RikF6UK53 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933403O08RikF6UK53 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933403O08RikF6UK53 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933403O08RikF6UK53 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933403O08RikF6UK53 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933403O08RikF6UK53 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933403O08RikF6UK53 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4933403O08RikF6UK53 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933403O08RikF6UK53 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4933403O08RikF6UK53 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933403O08RikF6UK53 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933403O08RikF6UK53 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
4933403O08RikF6UK53 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933403O08RikF6UK53 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
4933403O08RikF6UK53 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933403O08RikF6UK53 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933403O08RikF6UK53 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933403O08RikF6UK53 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4933403O08RikF6UK53 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4933403O08RikF6UK53 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
4933403O08RikF6UK53 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933403O08RikF6UK53 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933403O08RikF6UK53 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933403O08RikF6UK53 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933403O08RikF6UK53 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933403O08RikF6UK53 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933403O08RikF6UK53 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933403O08RikF6UK53 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933403O08RikF6UK53 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933403O08RikF6UK53 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933403O08RikF6UK53 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933403O08RikF6UK53 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
4933403O08RikF6UK53 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933403O08RikF6UK53 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933403O08RikF6UK53 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4933403O08RikF6UK53 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4933403O08RikF6UK53 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4933403O08RikF6UK53 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4933403O08RikF6UK53 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4933403O08RikF6UK53 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4933403O08RikF6UK53 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4933403O08RikF6UK53 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4933403O08RikF6UK53 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4933403O08RikF6UK53 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4933403O08RikF6UK53 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
4933403O08RikF6UK53 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4933403O08RikF6UK53 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
4933403O08RikF6UK53 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4933403O08RikF6UK53 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4933403O08RikF6UK53 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4933403O08RikF6UK53 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4933403O08RikF6UK53 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4933403O08RikF6UK53 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4933403O08RikF6UK53 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4933403O08RikF6UK53 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933403O08RikF6UK53 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933403O08RikF6UK53 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
4933403O08RikF6UK53 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4933403O08RikF6UK53 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933403O08RikF6UK53 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933403O08RikF6UK53 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933403O08RikF6UK53 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933403O08RikF6UK53 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933403O08RikF6UK53 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933403O08RikF6UK53 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933403O08RikF6UK53 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933403O08RikF6UK53 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933403O08RikF6UK53 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4933403O08RikF6UK53 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933403O08RikF6UK53 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933403O08RikF6UK53 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933403O08RikF6UK53 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933403O08RikF6UK53 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933403O08RikF6UK53 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933403O08RikF6UK53 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933403O08RikF6UK53 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933403O08RikF6UK53 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933403O08RikF6UK53 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933403O08RikF6UK53 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
4933403O08RikF6UK53 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933403O08RikF6UK53 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933403O08RikF6UK53 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933403O08RikF6UK53 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.6 ms