Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Plekhg1F6S200 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Plekhg1F6S200 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Plekhg1F6S200 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Plekhg1F6S200 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Plekhg1F6S200 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Plekhg1F6S200 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Plekhg1F6S200 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Plekhg1F6S200 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Plekhg1F6S200 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Plekhg1F6S200 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Plekhg1F6S200 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Plekhg1F6S200 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Plekhg1F6S200 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Plekhg1F6S200 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Plekhg1F6S200 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Plekhg1F6S200 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Plekhg1F6S200 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Plekhg1F6S200 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Plekhg1F6S200 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Plekhg1F6S200 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Plekhg1F6S200 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
Plekhg1F6S200 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Plekhg1F6S200 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Plekhg1F6S200 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Plekhg1F6S200 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Plekhg1F6S200 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Plekhg1F6S200 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Plekhg1F6S200 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Plekhg1F6S200 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Plekhg1F6S200 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Plekhg1F6S200 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Plekhg1F6S200 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Plekhg1F6S200 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Plekhg1F6S200 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Plekhg1F6S200 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Plekhg1F6S200 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Plekhg1F6S200 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Plekhg1F6S200 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Plekhg1F6S200 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Plekhg1F6S200 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Plekhg1F6S200 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Plekhg1F6S200 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Plekhg1F6S200 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Plekhg1F6S200 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Plekhg1F6S200 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Plekhg1F6S200 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Plekhg1F6S200 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Plekhg1F6S200 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Plekhg1F6S200 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Plekhg1F6S200 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Plekhg1F6S200 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Plekhg1F6S200 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Plekhg1F6S200 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Plekhg1F6S200 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Plekhg1F6S200 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Plekhg1F6S200 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Plekhg1F6S200 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Plekhg1F6S200 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Plekhg1F6S200 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Plekhg1F6S200 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Plekhg1F6S200 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Plekhg1F6S200 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Plekhg1F6S200 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Plekhg1F6S200 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Plekhg1F6S200 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Plekhg1F6S200 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Plekhg1F6S200 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Plekhg1F6S200 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Plekhg1F6S200 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Plekhg1F6S200 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Plekhg1F6S200 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Plekhg1F6S200 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Plekhg1F6S200 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Plekhg1F6S200 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Plekhg1F6S200 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Plekhg1F6S200 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Plekhg1F6S200 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Plekhg1F6S200 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Plekhg1F6S200 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Plekhg1F6S200 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Plekhg1F6S200 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Plekhg1F6S200 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Plekhg1F6S200 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Plekhg1F6S200 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Plekhg1F6S200 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Plekhg1F6S200 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Plekhg1F6S200 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Plekhg1F6S200 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Plekhg1F6S200 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Plekhg1F6S200 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Plekhg1F6S200 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Plekhg1F6S200 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Plekhg1F6S200 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Plekhg1F6S200 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Plekhg1F6S200 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Plekhg1F6S200 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Plekhg1F6S200 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Plekhg1F6S200 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Plekhg1F6S200 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms