Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Col22a1E9Q7P1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Col22a1E9Q7P1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Col22a1E9Q7P1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Col22a1E9Q7P1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Col22a1E9Q7P1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Col22a1E9Q7P1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Col22a1E9Q7P1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Col22a1E9Q7P1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Col22a1E9Q7P1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Col22a1E9Q7P1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Col22a1E9Q7P1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Col22a1E9Q7P1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Col22a1E9Q7P1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Col22a1E9Q7P1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Col22a1E9Q7P1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Col22a1E9Q7P1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Col22a1E9Q7P1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Col22a1E9Q7P1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Col22a1E9Q7P1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Col22a1E9Q7P1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Col22a1E9Q7P1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Col22a1E9Q7P1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Col22a1E9Q7P1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Col22a1E9Q7P1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Col22a1E9Q7P1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Col22a1E9Q7P1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Col22a1E9Q7P1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Col22a1E9Q7P1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Col22a1E9Q7P1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Col22a1E9Q7P1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Col22a1E9Q7P1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Col22a1E9Q7P1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Col22a1E9Q7P1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Col22a1E9Q7P1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Col22a1E9Q7P1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Col22a1E9Q7P1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Col22a1E9Q7P1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Col22a1E9Q7P1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Col22a1E9Q7P1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Col22a1E9Q7P1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Col22a1E9Q7P1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Col22a1E9Q7P1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Col22a1E9Q7P1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Col22a1E9Q7P1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Col22a1E9Q7P1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Col22a1E9Q7P1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Col22a1E9Q7P1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Col22a1E9Q7P1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Col22a1E9Q7P1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Col22a1E9Q7P1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Col22a1E9Q7P1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Col22a1E9Q7P1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Col22a1E9Q7P1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Col22a1E9Q7P1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Col22a1E9Q7P1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Col22a1E9Q7P1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Col22a1E9Q7P1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Col22a1E9Q7P1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Col22a1E9Q7P1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Col22a1E9Q7P1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Col22a1E9Q7P1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Col22a1E9Q7P1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Col22a1E9Q7P1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Col22a1E9Q7P1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Col22a1E9Q7P1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Col22a1E9Q7P1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Col22a1E9Q7P1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Col22a1E9Q7P1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Col22a1E9Q7P1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Col22a1E9Q7P1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Col22a1E9Q7P1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Col22a1E9Q7P1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Col22a1E9Q7P1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Col22a1E9Q7P1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Col22a1E9Q7P1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Col22a1E9Q7P1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Col22a1E9Q7P1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Col22a1E9Q7P1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Col22a1E9Q7P1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Col22a1E9Q7P1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Col22a1E9Q7P1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Col22a1E9Q7P1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Col22a1E9Q7P1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Col22a1E9Q7P1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Col22a1E9Q7P1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Col22a1E9Q7P1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Col22a1E9Q7P1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Col22a1E9Q7P1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Col22a1E9Q7P1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Col22a1E9Q7P1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Col22a1E9Q7P1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Col22a1E9Q7P1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Col22a1E9Q7P1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Col22a1E9Q7P1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Col22a1E9Q7P1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
Col22a1E9Q7P1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Col22a1E9Q7P1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Col22a1E9Q7P1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Col22a1E9Q7P1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms