Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5F9

Setd2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, mousemouse

Predictions only

Length 2,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd2E9Q5F9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd2E9Q5F9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setd2E9Q5F9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setd2E9Q5F9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setd2E9Q5F9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setd2E9Q5F9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setd2E9Q5F9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Setd2E9Q5F9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Setd2E9Q5F9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Setd2E9Q5F9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Setd2E9Q5F9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Setd2E9Q5F9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Setd2E9Q5F9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Setd2E9Q5F9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Setd2E9Q5F9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Setd2E9Q5F9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd2E9Q5F9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd2E9Q5F9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Setd2E9Q5F9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Setd2E9Q5F9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Setd2E9Q5F9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd2E9Q5F9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd2E9Q5F9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Setd2E9Q5F9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Setd2E9Q5F9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Setd2E9Q5F9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Setd2E9Q5F9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Setd2E9Q5F9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Setd2E9Q5F9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Setd2E9Q5F9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Setd2E9Q5F9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Setd2E9Q5F9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Setd2E9Q5F9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Setd2E9Q5F9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Setd2E9Q5F9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Setd2E9Q5F9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Setd2E9Q5F9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Setd2E9Q5F9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Setd2E9Q5F9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Setd2E9Q5F9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Setd2E9Q5F9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Setd2E9Q5F9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Setd2E9Q5F9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Setd2E9Q5F9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Setd2E9Q5F9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd2E9Q5F9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd2E9Q5F9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd2E9Q5F9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Setd2E9Q5F9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Setd2E9Q5F9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd2E9Q5F9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Setd2E9Q5F9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Setd2E9Q5F9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Setd2E9Q5F9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Setd2E9Q5F9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd2E9Q5F9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd2E9Q5F9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Setd2E9Q5F9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Setd2E9Q5F9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Setd2E9Q5F9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Setd2E9Q5F9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd2E9Q5F9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Setd2E9Q5F9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setd2E9Q5F9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Setd2E9Q5F9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Setd2E9Q5F9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Setd2E9Q5F9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Setd2E9Q5F9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setd2E9Q5F9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Setd2E9Q5F9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setd2E9Q5F9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd2E9Q5F9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd2E9Q5F9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setd2E9Q5F9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd2E9Q5F9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd2E9Q5F9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd2E9Q5F9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Setd2E9Q5F9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setd2E9Q5F9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setd2E9Q5F9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setd2E9Q5F9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Setd2E9Q5F9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Setd2E9Q5F9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Setd2E9Q5F9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setd2E9Q5F9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setd2E9Q5F9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setd2E9Q5F9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Setd2E9Q5F9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd2E9Q5F9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd2E9Q5F9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd2E9Q5F9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setd2E9Q5F9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd2E9Q5F9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd2E9Q5F9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd2E9Q5F9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd2E9Q5F9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd2E9Q5F9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Setd2E9Q5F9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd2E9Q5F9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Setd2E9Q5F9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.6 ms