Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DspE9Q557 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DspE9Q557 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DspE9Q557 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DspE9Q557 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DspE9Q557 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DspE9Q557 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DspE9Q557 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DspE9Q557 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DspE9Q557 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DspE9Q557 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DspE9Q557 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DspE9Q557 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DspE9Q557 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DspE9Q557 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DspE9Q557 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DspE9Q557 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DspE9Q557 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DspE9Q557 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DspE9Q557 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DspE9Q557 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DspE9Q557 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DspE9Q557 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DspE9Q557 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DspE9Q557 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DspE9Q557 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DspE9Q557 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DspE9Q557 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DspE9Q557 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DspE9Q557 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DspE9Q557 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DspE9Q557 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DspE9Q557 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DspE9Q557 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DspE9Q557 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DspE9Q557 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
DspE9Q557 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DspE9Q557 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DspE9Q557 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DspE9Q557 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DspE9Q557 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DspE9Q557 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DspE9Q557 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DspE9Q557 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DspE9Q557 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DspE9Q557 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
DspE9Q557 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DspE9Q557 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DspE9Q557 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DspE9Q557 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DspE9Q557 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DspE9Q557 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DspE9Q557 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DspE9Q557 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DspE9Q557 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DspE9Q557 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DspE9Q557 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DspE9Q557 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DspE9Q557 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DspE9Q557 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DspE9Q557 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DspE9Q557 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DspE9Q557 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DspE9Q557 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DspE9Q557 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DspE9Q557 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DspE9Q557 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DspE9Q557 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DspE9Q557 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DspE9Q557 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DspE9Q557 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DspE9Q557 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DspE9Q557 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DspE9Q557 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DspE9Q557 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DspE9Q557 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DspE9Q557 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DspE9Q557 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DspE9Q557 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DspE9Q557 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DspE9Q557 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DspE9Q557 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DspE9Q557 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DspE9Q557 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DspE9Q557 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DspE9Q557 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DspE9Q557 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DspE9Q557 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DspE9Q557 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DspE9Q557 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DspE9Q557 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DspE9Q557 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DspE9Q557 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DspE9Q557 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DspE9Q557 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DspE9Q557 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DspE9Q557 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DspE9Q557 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DspE9Q557 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DspE9Q557 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms