Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

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Length 4,418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hectd4E9Q2E4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hectd4E9Q2E4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd4E9Q2E4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hectd4E9Q2E4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hectd4E9Q2E4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hectd4E9Q2E4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd4E9Q2E4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd4E9Q2E4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd4E9Q2E4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd4E9Q2E4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd4E9Q2E4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd4E9Q2E4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd4E9Q2E4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd4E9Q2E4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd4E9Q2E4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hectd4E9Q2E4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hectd4E9Q2E4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hectd4E9Q2E4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hectd4E9Q2E4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hectd4E9Q2E4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hectd4E9Q2E4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd4E9Q2E4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd4E9Q2E4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd4E9Q2E4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd4E9Q2E4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd4E9Q2E4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd4E9Q2E4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd4E9Q2E4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hectd4E9Q2E4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hectd4E9Q2E4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd4E9Q2E4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd4E9Q2E4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd4E9Q2E4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd4E9Q2E4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd4E9Q2E4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd4E9Q2E4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd4E9Q2E4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hectd4E9Q2E4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hectd4E9Q2E4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hectd4E9Q2E4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hectd4E9Q2E4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hectd4E9Q2E4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd4E9Q2E4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd4E9Q2E4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd4E9Q2E4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hectd4E9Q2E4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hectd4E9Q2E4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd4E9Q2E4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd4E9Q2E4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd4E9Q2E4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hectd4E9Q2E4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hectd4E9Q2E4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hectd4E9Q2E4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hectd4E9Q2E4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hectd4E9Q2E4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hectd4E9Q2E4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hectd4E9Q2E4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hectd4E9Q2E4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hectd4E9Q2E4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hectd4E9Q2E4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hectd4E9Q2E4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hectd4E9Q2E4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hectd4E9Q2E4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hectd4E9Q2E4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hectd4E9Q2E4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hectd4E9Q2E4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hectd4E9Q2E4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hectd4E9Q2E4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hectd4E9Q2E4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hectd4E9Q2E4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hectd4E9Q2E4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hectd4E9Q2E4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hectd4E9Q2E4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hectd4E9Q2E4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hectd4E9Q2E4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hectd4E9Q2E4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hectd4E9Q2E4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hectd4E9Q2E4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hectd4E9Q2E4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hectd4E9Q2E4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hectd4E9Q2E4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hectd4E9Q2E4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hectd4E9Q2E4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hectd4E9Q2E4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hectd4E9Q2E4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hectd4E9Q2E4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hectd4E9Q2E4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd4E9Q2E4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd4E9Q2E4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd4E9Q2E4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd4E9Q2E4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd4E9Q2E4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd4E9Q2E4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hectd4E9Q2E4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd4E9Q2E4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd4E9Q2E4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hectd4E9Q2E4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hectd4E9Q2E4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hectd4E9Q2E4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms