Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Myo5cE9Q1F5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Myo5cE9Q1F5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
Myo5cE9Q1F5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Myo5cE9Q1F5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Myo5cE9Q1F5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Myo5cE9Q1F5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Myo5cE9Q1F5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Myo5cE9Q1F5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Myo5cE9Q1F5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Myo5cE9Q1F5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Myo5cE9Q1F5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Myo5cE9Q1F5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Myo5cE9Q1F5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Myo5cE9Q1F5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Myo5cE9Q1F5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Myo5cE9Q1F5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Myo5cE9Q1F5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Myo5cE9Q1F5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Myo5cE9Q1F5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Myo5cE9Q1F5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Myo5cE9Q1F5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Myo5cE9Q1F5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
Myo5cE9Q1F5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
Myo5cE9Q1F5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Myo5cE9Q1F5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Myo5cE9Q1F5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Myo5cE9Q1F5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Myo5cE9Q1F5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Myo5cE9Q1F5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Myo5cE9Q1F5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Myo5cE9Q1F5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Myo5cE9Q1F5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Myo5cE9Q1F5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Myo5cE9Q1F5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Myo5cE9Q1F5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Myo5cE9Q1F5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Myo5cE9Q1F5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Myo5cE9Q1F5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Myo5cE9Q1F5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Myo5cE9Q1F5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Myo5cE9Q1F5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Myo5cE9Q1F5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Myo5cE9Q1F5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Myo5cE9Q1F5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Myo5cE9Q1F5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Myo5cE9Q1F5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Myo5cE9Q1F5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Myo5cE9Q1F5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Myo5cE9Q1F5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Myo5cE9Q1F5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Myo5cE9Q1F5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Myo5cE9Q1F5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Myo5cE9Q1F5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Myo5cE9Q1F5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Myo5cE9Q1F5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Myo5cE9Q1F5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Myo5cE9Q1F5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Myo5cE9Q1F5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Myo5cE9Q1F5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Myo5cE9Q1F5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Myo5cE9Q1F5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Myo5cE9Q1F5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Myo5cE9Q1F5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Myo5cE9Q1F5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Myo5cE9Q1F5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Myo5cE9Q1F5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Myo5cE9Q1F5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Myo5cE9Q1F5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Myo5cE9Q1F5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Myo5cE9Q1F5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Myo5cE9Q1F5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Myo5cE9Q1F5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Myo5cE9Q1F5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Myo5cE9Q1F5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Myo5cE9Q1F5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Myo5cE9Q1F5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Myo5cE9Q1F5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Myo5cE9Q1F5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Myo5cE9Q1F5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Myo5cE9Q1F5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Myo5cE9Q1F5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Myo5cE9Q1F5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Myo5cE9Q1F5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Myo5cE9Q1F5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Myo5cE9Q1F5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Myo5cE9Q1F5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Myo5cE9Q1F5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Myo5cE9Q1F5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Myo5cE9Q1F5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Myo5cE9Q1F5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Myo5cE9Q1F5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Myo5cE9Q1F5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Myo5cE9Q1F5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Myo5cE9Q1F5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Myo5cE9Q1F5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Myo5cE9Q1F5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Myo5cE9Q1F5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Myo5cE9Q1F5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
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